RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 FCGR1BQ92637 280 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 DMRTB1Q96MA1 342 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PDCD2LQ9BRP1 358 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 DNAJC18Q9H819 358 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 MALT1Q9UDY8 824 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF180Q9UJW8 692 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CDC14AQ9UNH5 594 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 VWA7Q9Y334 891 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF609O15014 1411 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SCELO95171 688 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 GADD45GO95257 159 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ABHD2P08910 425 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PCSK2P16519 638 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 DRD4P21917 467 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 GSTM2P28161 218 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ICAM3P32942 547 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 GNG2P59768 71 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 MAXP61244 160 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ECT2LQ008S8 904 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CACNG1Q06432 222 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 BST1Q10588 318 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TUBA3CQ13748 450 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 IFI44LQ53G44 452 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 LDLRAP1Q5SW96 308 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 NYAP1Q6ZVC0 841 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CHST9Q7L1S5 443 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SPPL2CQ8IUH8 684 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SPATA6LQ8N4H0 392 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 OR4K17Q8NGC6 315 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ACER1Q8TDN7 264 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC22A17Q8WUG5 538 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SEC14L1Q92503 715 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF347Q96SE7 839 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF649Q9BS31 505 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF670Q9BS34 389 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TLE6Q9H808 572 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 COMMD3Q9UBI1 195 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CRB1P82279 1406 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SAMD9Q5K651 1589 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 OR6C6A6NF89 314 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 H3BNX3 289 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CCRL2O00421 344 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 FBP2O00757 339 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CXCL11O14625 94 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 IFNA5P01569 189 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 IFNA4P05014 189 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CYP1A2P05177 515 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CYP3A7P24462 503 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 GNRHRP30968 328 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 VASPP50552 380 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 BNIP3Q12983 259 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CTBP1Q13363 440 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ABRAXAS2Q15018 415 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 WSCD2Q2TBF2 565 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 GK5Q6ZS86 529 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 LAS2Q8IYD9 372 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CLIP4Q8N3C7 705 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 JAGN1Q8N5M9 183 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 MAB21L3Q8N8X9 362 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ATAD1Q8NBU5 361 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PLA2G15Q8NCC3 412 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 FBXO22Q8NEZ5 403 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 OR5J2Q8NH18 312 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 AGAP11Q8TF27 550 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SSX3Q99909 188 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 DPYSL5Q9BPU6 564 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SEC61A2Q9H9S3 476 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 PLEKHA3Q9HB20 300 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 BRD7Q9NPI1 651 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 GIN1Q9NXP7 522 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 FBXO5Q9UKT4 447 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SQORQ9Y6N5 450 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CCDC85CA6NKD9 419 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 OR6C75A6NL08 312 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TLR5O60602 858 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 CLDN11O75508 207 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 STK16O75716 305 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 TGDSO95455 350 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 IFI30P13284 250 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-215ENST00000624145 ETS2P15036 469 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms