RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GH2	P01242	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	APOA4	P06727	396 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GCA	P28676	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UQCRC1	P31930	480 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATIC	P31939	592 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDKN2B	P42772	138 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NAMPT	P43490	491 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MARCKSL1	P49006	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NR2C2	P49116	596 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PEX3	P56589	373 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CREB5	Q02930	508 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MED21	Q13503	144 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRPC3	Q13507	836 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SNX1	Q13596	522 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DPYSL3	Q14195	570 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	COG2	Q14746	738 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	USH1G	Q495M9	461 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ERO1B	Q86YB8	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRC43	Q8N309	656 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CDKL2	Q92772	493 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PLLP	Q9Y342	182 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OTOF	Q9HC10	1997 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HACD1	B0YJ81	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525		K7ERI5	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SGK1	O00141	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SLC16A4	O15374	487 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CHMP2A	O43633	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CREB3	O43889	395 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ATP9A	O75110	1047 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SPAG7	O75391	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NDUFB8	O95169	186 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IL18RAP	O95256	599 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GH1	P01241	217 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC166	P0CW27	439 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AR	P10275	920 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KRT3	P12035	628 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TNNI1	P19237	187 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TPSB2	P20231	275 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TGM2	P21980	687 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KDELR1	P24390	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCND2	P30279	289 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	COPB2	P35606	906 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GABRB2	P47870	512 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LIG4	P49917	911 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SERPINB8	P50452	374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GPX6	P59796	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BTK	Q06187	659 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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