RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 ASB9Q96DX5 294 aa24.99■■□□□ 1.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM74BQ9NUR3 256 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFAF1Q9Y375 327 aa24.99■■□□□ 1.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 E5RI56 91 aa24.98■■□□□ 1.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 PIGKQ92643 395 aa24.98■■□□□ 1.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 PRR35P0CG20 571 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 IDO1P14902 403 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 ITGALP20701 1170 aa24.97■■□□□ 1.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 EXT2Q93063 718 aa24.97■■□□□ 1.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 STON1Q9Y6Q2 735 aa24.97■■□□□ 1.59
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CAPNS1-204ENST00000587718 ARMCX6Q7L4S7 300 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R42Q7RTR8 314 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 WFDC5Q8TCV5 224 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 TRPC4APQ8TEL6 797 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 NPAS2Q99743 824 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP44Q9C0F1 390 aa24.96■■□□□ 1.59
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