RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ALOX15BO15296 676 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PPIP5K2O43314 1243 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KCNQ3O43525 872 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ENTPD3O75355 529 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 JRKO75564 520 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SERPINB7O75635 380 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FAM155BO75949 473 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 IL18RAPO95256 599 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TNFRSF6BO95407 300 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 VNN2O95498 520 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 C22orf31O95567 290 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CH25HO95992 272 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MT-ATP6P00846 226 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 APOC1P02654 83 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 YES1P07947 543 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KRT19P08727 400 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TFPTP0C1Z6 253 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 OR4E1P0C645 316 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 OR8G3PP0DMU2 310 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MCF2P10911 925 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SLC2A3P11169 496 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GFAPP14136 432 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 IL1R1P14778 569 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NT5EP21589 574 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GSTM2P28161 218 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CCND2P30279 289 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 HOXA9P31269 272 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 HOXC8P31273 242 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GTF2H1P32780 548 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NUDT1P36639 197 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SYKP43405 635 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KIR3DL2P43630 455 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SLC1A6P48664 564 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FNTBP49356 437 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GNG10P50151 68 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SLC26A2P50443 739 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CCR4P51679 360 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 STAT2P52630 851 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NAGLUP54802 743 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NME5P56597 212 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CLDN8P56748 225 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 STX1BP61266 288 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GNAI1P63096 354 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PHC1P78364 1004 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 OCA2Q04671 838 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF33AQ06730 810 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CYP24A1Q07973 514 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MERTKQ12866 999 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 SCGB2A2Q13296 93 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NAB1Q13506 487 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FLOT2Q14254 428 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RPS6KA1Q15418 735 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CYTH1Q15438 398 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 GPR68Q15743 365 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TBCCQ15814 346 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 HKDC1Q2TB90 917 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PGS1Q32NB8 556 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 P3H1Q32P28 736 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 UAP1L1Q3KQV9 507 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MOGAT2Q3SYC2 334 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PLA1AQ53H76 456 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf146Q5VVC0 180 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 C18orf63Q68DL7 685 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 DUPD1Q68J44 220 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 PMF1Q6P1K2 205 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TTC27Q6P3X3 843 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 IL20RBQ6UXL0 311 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 BBS12Q6ZW61 710 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 COPS6Q7L5N1 327 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ADGRA1Q86SQ6 560 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 IQCHQ86VS3 1027 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 AMZ2Q86W34 360 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM69Q86WT6 500 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NME9Q86XW9 330 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KBTBD3Q8NAB2 608 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 OR13C3Q8NGS6 347 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 OR52N1Q8NH53 320 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NCOA7Q8NI08 942 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF596Q8TC21 504 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FAM71BQ8TC56 605 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ST7LQ8TDW4 575 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 DTD1Q8TEA8 209 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 STYXQ8WUJ0 223 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 KCTD4Q8WVF5 259 aa3.01□□□□□ -1.93
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