RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	BRD3	Q15059	726 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	PCID2	Q5JVF3	399 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	C4orf22	Q6V702	233 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	PACS1	Q6VY07	963 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	D2HGDH	Q8N465	521 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM58	Q8NG06	486 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	OR4L1	Q8NH43	312 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	STARD8	Q92502	1023 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	ELMO1	Q92556	727 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	LHX9	Q9NQ69	397 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	KCND1	Q9NSA2	647 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	STARD5	Q9NSY2	213 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	KCND3	Q9UK17	655 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	CROT	Q9UKG9	612 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	9.14	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	ATM	Q13315	3056 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	GSAP	A4D1B5	854 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479		J3QKU1	62 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	AP3B1	O00203	1094 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	BTN3A3	O00478	584 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	CEP104	O60308	925 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TIAF1	O95411	115 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	FGG	P02679	453 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	F8A1	P23610	371 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	NPY2R	P49146	381 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	POLE2	P56282	527 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TUBB4B	P68371	445 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	PRAME	P78395	509 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	ACVR1	Q04771	509 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	CDC20	Q12834	499 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNAB2	Q13303	367 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TUBB2A	Q13885	445 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	ERV3-1	Q14264	604 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	9.13	□□□□□ -0.95
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KIFC3-231	ENST00000567479	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	9.13	□□□□□ -0.95
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KIFC3-231	ENST00000567479	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	OR8K5	Q8NH50	307 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	9.13	□□□□□ -0.95
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KIFC3-231	ENST00000567479	SGSM3	Q96HU1	749 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	PPM1M	Q96MI6	270 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF778	Q96MU6	729 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	POLG2	Q9UHN1	485 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	POMT2	Q9UKY4	750 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	ASF1A	Q9Y294	204 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	BTRC	Q9Y297	605 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	SDK2	Q58EX2	2172 aa		9.13	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	KALRN	O60229	2985 aa		9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	PIPSL	A2A3N6	862 aa		9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	C2orf74	A8MZ97	194 aa		9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	C21orf140	B9A014	251 aa		9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	BTN3A1	O00481	513 aa		9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC28A2	O43868	658 aa		9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	OR1I1	O60431	355 aa		9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	CREG1	O75629	220 aa		9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	SCRG1	O75711	98 aa		9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	RECK	O95980	971 aa		9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	ACADL	P28330	430 aa		9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	CXCR5	P32302	372 aa		9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNJ1	P48048	391 aa		9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	CCZ1B	P86790	482 aa		9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	9.12	□□□□□ -0.95
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR19	Q15760	415 aa		9.12	□□□□□ -0.95

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