RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	IMPG1	Q17R60	797 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TTC23L	Q6PF05	361 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	MACC1	Q6ZN28	852 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	STK32C	Q86UX6	486 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	SVOPL	Q8N434	492 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	MUS81	Q96NY9	551 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PREB	Q9HCU5	417 aa		18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf78	A6NCI8	922 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559		G3V2T6	193 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	DFNA5	O60443	496 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM16	O95361	564 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	SEC24A	O95486	1093 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CPNE6	O95741	557 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TRBC1	P01850	177 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	EPB42	P16452	691 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PCSK2	P16519	638 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	BCL2L1	Q07817	233 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PTGR1	Q14914	329 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TPGS2	Q68CL5	300 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	FIG4	Q92562	907 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	WBP2	Q969T9	261 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ULK4	Q96C45	1275 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	NRBF2	Q96F24	287 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ZIC5	Q96T25	663 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	APOL5	Q9BWW9	433 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	IL26	Q9NPH9	171 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		18.06	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0J9YVX5	310 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559		H3BMQ9	156 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	EFEMP2	O95967	443 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PGR	P06401	933 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ITGB6	P18564	788 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	SP3	Q02447	781 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PLD1	Q13393	1074 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	MYBPC3	Q14896	1274 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	GPNMB	Q14956	572 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PAF1	Q8N7H5	531 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	COG8	Q96MW5	612 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	BOC	Q9BWV1	1114 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	HPS4	Q9NQG7	708 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PFDN1	O60925	122 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	SOCS5	O75159	536 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ABLIM3	O94929	683 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CSK	P41240	450 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CSNK1D	P48730	415 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PTPN5	P54829	565 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TUBA3C	Q13748	450 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	BROX	Q5VW32	411 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	GPR107	Q5VW38	600 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	OR10A6	Q8NH74	314 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	THAP11	Q96EK4	314 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	ALG14	Q96F25	216 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CLMP	Q9H6B4	373 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	KL	Q9UEF7	1012 aa		18.05	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM64B	A6NI03	449 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559		H0Y858	1186 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	SEC22B	O75396	215 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	RET	P07949	1114 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CBSL	P0DN79	551 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	HOXD10	P28358	340 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CBS	P35520	551 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CTBS	Q01459	385 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	CAP1	Q01518	475 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	PHKG1	Q16816	387 aa		18.04	■□□□□ 0.48
RRN3-205	ENST00000563559	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48

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