RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	PMP22	Q01453	160 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ELP6	Q0PNE2	266 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	USP41	Q3LFD5	358 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF410	Q86VK4	478 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	BATF2	Q8N1L9	274 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF139	Q8WU17	664 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ASB5	Q8WWX0	329 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLAMF9	Q96A28	289 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CDRT15	Q96T59	188 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GPA33	Q99795	319 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SSX3	Q99909	188 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ERP44	Q9BS26	406 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	THAP2	Q9H0W7	228 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNK15	Q9H427	330 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SPAST	Q9UBP0	616 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		2.76	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ACE	P12821	1306 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	EVPL	Q92817	2033 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	XKRY2	A2RUG3	117 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM30	A4D0T7	59 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DPPA5	A6NC42	116 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CBY3	A6NI87	242 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957		H0YIV9	168 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	OGG1	O15527	345 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	STRN	O43815	780 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	JRK	O75564	520 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	PRDM1	O75626	825 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	NKX2-2	O95096	273 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	DIRAS3	O95661	229 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	MT-ATP6	P00846	226 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GH1	P01241	217 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RLN1	P04808	185 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CYC1	P08574	325 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52Z1	P0C646	297 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GNAZ	P19086	355 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GLRA2	P23416	452 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	GSTM2	P28161	218 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	TMOD1	P28289	359 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXD10	P28358	340 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	SFN	P31947	248 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	OTX2	P32243	289 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRNA3	P32297	505 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	RFC4	P35249	363 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP5O	P48047	213 aa		2.75	□□□□□ -1.97
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms