RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558960.1

ADAMTS17-205, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 2

Gene ADAMTS17, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-205ENST00000558960 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 CHD8Q9HCK8 2581 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 IQCF5A8MTL0 148 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 ITGA2BP08514 1039 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 MPSTP25325 297 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 ACADLP28330 430 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 PRKAA1Q13131 559 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 CTBP1Q13363 440 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 ST3GAL2Q16842 350 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 TMEM164Q5U3C3 297 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC22A15Q8IZD6 547 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 KRT222Q8N1A0 295 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 RCBTB1Q8NDN9 531 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 PHC3Q8NDX5 983 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 LCN9Q8WX39 176 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 C9orf72Q96LT7 481 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 LATS2Q9NRM7 1088 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 HRASLS2Q9NWW9 162 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 TMEM9Q9P0T7 183 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 CHMP2BQ9UQN3 213 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 AKAP13Q12802 2813 aa20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 CTAGE15A4D2H0 777 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 A8MU76 341 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 E7ESA3 106 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 MATN2O00339 956 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 BANF1O75531 89 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLCO2B1O94956 709 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 CTAGE8P0CG41 777 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 IRGCQ6NXR0 463 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 TTC23LQ6PF05 361 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 CTAGE6Q86UF2 777 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 CTAGE4Q8IX94 777 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 RSC1A1Q92681 617 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 CERS2Q96G23 380 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 CFAP36Q96G28 342 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 PWWP2AQ96N64 755 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 FOPNLQ96NB1 174 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 TGM7Q96PF1 710 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 B3GNT4Q9C0J1 378 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 SRMSQ9H3Y6 488 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 PISDQ9UG56 409 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 KLHL3Q9UH77 587 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa20.46■□□□□ 0.87
ADAMTS17-205ENST00000558960 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR5K3A6NET4 321 aa20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 TP73O15350 636 aa20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 ANKRD34CP0C6C1 535 aa20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 ERVK-10P10266 1014 aa20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC1A2P43004 574 aa20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 TTLL9Q3SXZ7 439 aa20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 FBXO36Q8NEA4 188 aa20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR5K2Q8NHB8 316 aa20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 CD180Q99467 661 aa20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 KLHL42Q9P2K6 505 aa20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.45■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR6C74A6NCV1 312 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 RRP8O43159 456 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 RASSF9O75901 435 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 MAPK10P53779 464 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 PLTPP55058 493 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 CACHD1Q5VU97 1274 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 STEAP4Q687X5 459 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 UGT3A1Q6NUS8 523 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 ANKMY2Q8IV38 441 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 PALM2Q8IXS6 379 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 CEP112Q8N8E3 955 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 PYROXD1Q8WU10 500 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 ART4Q93070 314 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 TAAR9Q96RI9 348 aa20.44■□□□□ 0.86
ADAMTS17-205ENST00000558960 PHACTR1Q9C0D0 580 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms