RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 M0QZ92 97 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 MTA2O94776 668 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 DHRS4L1P0CG22 281 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 MAN1A1P33908 653 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 HNF1BP35680 557 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 CCR10P46092 362 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 GPR12P47775 334 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 AMTP48728 403 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 CLK1P49759 484 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 PDLIM4P50479 330 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 TFAP4Q01664 338 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 WASHC5Q12768 1159 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 PLCB4Q15147 1175 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 FBXO43Q4G163 708 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 MARCH8Q5T0T0 291 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 SFMBT2Q5VUG0 894 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 GJB7Q6PEY0 223 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 KRT77Q7Z794 578 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 FJX1Q86VR8 437 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 MARCH9Q86YJ5 346 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC65Q8IXS2 484 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 C10orf67Q8IYJ2 551 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 IQUBQ8NA54 791 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 OR4N2Q8NGD1 307 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 RASSF8Q8NHQ8 419 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 FAM81BQ96LP2 452 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 IWS1Q96ST2 819 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 PXMP2Q9NR77 195 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 RGS18Q9NS28 235 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 COMMD8Q9NX08 183 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 ACAD8Q9UKU7 415 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 CLDN16Q9Y5I7 305 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 SPAG17Q6Q759 2223 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 CKAP5Q14008 2032 aa4.94□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 FAM25EA8MYX2 175 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 HBP1O60381 514 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 RPS6KA5O75582 802 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 SURF6O75683 361 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 SOX30O94993 753 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 CAVIN2O95810 425 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 SERPINC1P01008 464 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 CKMT1AP12532 417 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 LAMA1P25391 3075 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 MNAT1P51948 309 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 TRIM29Q14134 588 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 SHBQ15464 509 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 RPE65Q16518 533 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 MTSS1LQ765P7 747 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 AACSQ86V21 672 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 FAM114A1Q8IWE2 563 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 WDR63Q8IWG1 891 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 GHDCQ8N2G8 530 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 SPEM1Q8N4L4 309 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 CEP70Q8NHQ1 597 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 ITFG1Q8TB96 612 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 ING5Q8WYH8 240 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 FGF13Q92913 245 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 DOCK6Q96HP0 2047 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 IGSF21Q96ID5 467 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 COL12A1Q99715 3063 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 SLC32A1Q9H598 525 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 DOCK5Q9H7D0 1870 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 PTPRHQ9HD43 1115 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 HOMER3Q9NSC5 361 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 CHMP5Q9NZZ3 219 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 CDH7Q9ULB5 785 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 TMCC3Q9ULS5 477 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 V9GYY5 206 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 PLIN4Q96Q06 1357 aa4.92□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 ENO4A6NNW6 628 aa4.92□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 CAPN9O14815 690 aa4.92□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 TEX28O15482 410 aa4.92□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 SLC25A17O43808 307 aa4.92□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 EXTL3O43909 919 aa4.92□□□□□ -1.62
ATXN3-218ENST00000553309 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms