RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	NXNL1	Q96CM4	212 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	RNF112	Q9ULX5	631 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	ASF1A	Q9Y294	204 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658		A0A0G2JNG1	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC189	A1A4V9	331 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SYCE1L	A8MT33	242 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	FFAR2	O15552	330 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	ZBTB14	O43829	449 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	LRP3	O75074	770 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SPAG7	O75391	227 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF806	P0C7X5	589 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	CD1D	P15813	335 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	NDUFS1	P28331	727 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	GLRB	P48167	497 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	IRX4	P78413	519 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	BNC1	Q01954	994 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SLC18A2	Q05940	514 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SPEM2	Q0P670	501 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	KIR2DS5	Q14953	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC153	Q494R4	210 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	TTMP	Q5BVD1	217 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	NRROS	Q86YC3	692 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	VRK3	Q8IV63	474 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	MAPK15	Q8TD08	544 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	EXT2	Q93063	718 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	ARL8A	Q96BM9	186 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	TLCD1	Q96CP7	247 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	ALG9	Q9H6U8	611 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	MKS1	Q9NXB0	559 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	CDYL	Q9Y232	598 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	PCM1	Q15154	2024 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	KNL1	Q8NG31	2342 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	LMO7DN	F2Z398	122 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SLC16A5	O15375	505 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	SUPT3H	O75486	399 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	VIP	P01282	170 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	TAC1	P20366	129 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	BDKRB1	P46663	353 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	CSRP3	P50461	194 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	BNIP3	Q12983	259 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DDB1-223	ENST00000543658	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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