RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP2-209ENST00000504450 NLRP8Q86W28 1048 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 VRK3Q8IV63 474 aa10.57□□□□□ -0.72
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SH3BP2-209ENST00000504450 SNX31Q8N9S9 440 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 METTL6Q8TCB7 284 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 ROPN1LQ96C74 230 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 DCUN1D1Q96GG9 259 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 CDK15Q96Q40 435 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa10.57□□□□□ -0.72
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SH3BP2-209ENST00000504450 NMRK1Q9NWW6 199 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM181Q9P2C4 612 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 TRPS1Q9UHF7 1281 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 CROTQ9UKG9 612 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 HCN2Q9UL51 889 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
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SH3BP2-209ENST00000504450 XPAP23025 273 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
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SH3BP2-209ENST00000504450 OPRD1P41143 372 aa10.56□□□□□ -0.72
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SH3BP2-209ENST00000504450 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 APOL5Q9BWW9 433 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC32A1Q9H598 525 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 WWOXQ9NZC7 414 aa10.56□□□□□ -0.72
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SH3BP2-209ENST00000504450 OPTCQ9UBM4 332 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP2-209ENST00000504450 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
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