RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 KLHL9Q9P2J3 617 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa4.79□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.78□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa4.78□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 TMEM178BH3BS89 294 aa4.78□□□□□ -1.64
CCL20-204ENST00000489160 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.64
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CCL20-204ENST00000489160 MLLT10P55197 1068 aa4.76□□□□□ -1.65
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CCL20-204ENST00000489160 NHSL2Q5HYW2 709 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 GCNT6Q5T4J0 391 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 TATDN1Q6P1N9 297 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PRSS57Q6UWY2 283 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 RAD9BQ6WBX8 426 aa4.76□□□□□ -1.65
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