RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486274.5

TBC1D23-208, Transcript of TBC1 domain family member 23, human

TSL 5

Gene TBC1D23, Length 4,054 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D23-208	ENST00000486274	SELENON	Q9NZV5	590 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	USP3	Q9Y6I4	520 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	DHRS12	A0PJE2	317 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRAMEF12	O95522	483 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	NR2F1	P10589	423 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLC6A11	P48066	632 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	RAB8A	P61006	207 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	UFM1	P61960	85 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	HERVK_113	P63132	956 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	RABL3	Q5HYI8	236 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	GALNT10	Q86SR1	603 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	AHI1	Q8N157	1196 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	BDH2	Q9BUT1	245 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	WDR26	Q9H7D7	661 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	MRGBP	Q9NV56	204 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	CARNS1	A5YM72	827 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	KAT7	O95251	611 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	IMPDH1	P20839	514 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	HPCAL1	P37235	193 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	LIPE	Q05469	1076 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	PTGR1	Q14914	329 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	HKDC1	Q2TB90	917 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	CPTP	Q5TA50	214 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	FGF13	Q92913	245 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	PPCDC	Q96CD2	204 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	ABHD8	Q96I13	439 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	TAC3	Q9UHF0	121 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	IGLON5	A6NGN9	336 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRIM38	O00635	465 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	ETS2	P15036	469 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	HLA-F	P30511	346 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	IRGC	Q6NXR0	463 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	C16orf87	Q6PH81	154 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	MIPEP	Q99797	713 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274		A0A0J9YVX5	310 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274		A8MU76	341 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	CST1	P01037	141 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	OPN1SW	P03999	348 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	SRC	P12931	536 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	PEX2	P28328	305 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	PPP2R1B	P30154	601 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	NFKB2	Q00653	900 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	MGAT3	Q09327	533 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74	7e-7	■■■■□ 23.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	IER5L	Q5T953	404 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	NXPE1	Q8N323	547 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	MAPK15	Q8TD08	544 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	RLN3	Q8WXF3	142 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLC9A6	Q92581	669 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	POMP	Q9Y244	141 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274		K7EPI3	171 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	OR10H2	O60403	315 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	DIRAS1	O95057	198 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	UROS	P10746	265 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	BPI	P17213	487 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	GNAZ	P19086	355 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TBC1D23-208	ENST00000486274	NR4A1	P22736	598 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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