RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 PHLDA2Q53GA4 152 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa3.07□□□□□ -1.92
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SENP6-208ENST00000483859 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa3.07□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.07□□□□□ -1.92
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SENP6-208ENST00000483859 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
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SENP6-208ENST00000483859 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
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SENP6-208ENST00000483859 GAS1P54826 345 aa3.05□□□□□ -1.92
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SENP6-208ENST00000483859 SLC4A11Q8NBS3 891 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 KCNH5Q8NCM2 988 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 OR13J1Q8NGT2 312 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.929e-6■■■□□ 19
SENP6-208ENST00000483859 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 DUX5Q96PT3 197 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 PSD2Q9BQI7 771 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 AP1M1Q9BXS5 423 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 VN1R1Q9GZP7 353 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SENP6-208ENST00000483859 A4GALTQ9NPC4 353 aa3.05□□□□□ -1.92
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