RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481173.1

CCNL1-223, Transcript of cyclin L1, human

TSL 2

Gene CCNL1, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-223	ENST00000481173	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	P2RY12	Q9H244	342 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	SH2D4A	Q9H788	454 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	HHATL	Q9HCP6	504 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	RNF186	Q9NXI6	227 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	FBXL17	Q9UF56	701 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	NENF	Q9UMX5	172 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173		E9PI62	339 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	T	O15178	435 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	TMEM63A	O94886	807 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	OR2C1	O95371	312 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	GRAP	Q13588	217 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	TEAD2	Q15562	447 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	SARM1	Q6SZW1	724 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	SMC5	Q8IY18	1101 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	DCLK2	Q8N568	766 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	NAXE	Q8NCW5	288 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	MOAP1	Q96BY2	351 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	SGK494	Q96LW2	274 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	C7orf26	Q96N11	449 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	MUC13	Q9H3R2	512 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	AASS	Q9UDR5	926 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CCNL1-223	ENST00000481173	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173		A8MZ25	164 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	CLDN1	O95832	211 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	CLTB	P09497	229 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	PRG2	P13727	222 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	GABRB1	P18505	474 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	CA4	P22748	312 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	PON1	P27169	355 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	SHC1	P29353	583 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	MAPK4	P31152	587 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	MAGEA11	P43364	429 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	SUOX	P51687	545 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC8A3	P57103	927 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	PRAME	P78395	509 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	KRT32	Q14532	448 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	KLHL26	Q53HC5	615 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	CHST9	Q7L1S5	443 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	RNF128	Q8TEB7	428 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	OMA1	Q96E52	524 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	PPM1M	Q96MI6	270 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	DACH2	Q96NX9	599 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	ITPA	Q9BY32	194 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	RHCG	Q9UBD6	479 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	2.77	□□□□□ -1.97	3e-6	■■□□□ 14.3
CCNL1-223	ENST00000481173	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173		A0A1W2PR77	199 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	MSGN1	A6NI15	193 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF195	O14628	629 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	PI15	O43692	258 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	GPI	P06744	558 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	LAMP2	P13473	410 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	ACADS	P16219	412 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	ARL3	P36405	182 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	CDH8	P55286	799 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	DRP2	Q13474	957 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	KCNC3	Q14003	757 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	KRT33B	Q14525	404 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	MELK	Q14680	651 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	NECTIN1	Q15223	517 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CCNL1-223	ENST00000481173	E2F5	Q15329	346 aa		2.76	□□□□□ -1.97

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