RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 ACACAQ13085 2346 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 CGB1A6NKQ9 187 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 MAGEB17A8MXT2 336 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 PI15O43692 258 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 GPC4O75487 556 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC22A3O75751 556 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 HKR1P10072 659 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 UNGP13051 313 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 PRLRP16471 622 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 STMN1P16949 149 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR143P51810 404 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 CDH13P55290 713 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 TUBB4BP68371 445 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 BLOC1S1P78537 153 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 SPOCK1Q08629 439 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 PTK6Q13882 451 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 CAPSQ13938 189 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 SNAPC1Q16533 368 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 TYSND1Q2T9J0 566 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 CBWD6Q4V339 395 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 CBWD3Q5JTY5 395 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 HECTD2Q5U5R9 776 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM211Q6ICI0 200 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 CEP85Q6P2H3 762 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 TEX38Q6PEX7 206 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 CYB5R4Q7L1T6 521 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 SERPINA11Q86U17 422 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 MCEMP1Q8IX19 187 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 HACE1Q8IYU2 909 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 LCORLQ8N3X6 602 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 TRPC4APQ8TEL6 797 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 CORO2AQ92828 525 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 TBC1D31Q96DN5 1066 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 MGME1Q9BQP7 344 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 MMP27Q9H306 513 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 ADAM21Q9UKJ8 722 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNK7Q9Y2U2 307 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 AKAP13Q12802 2813 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 SIPA1L1O43166 1804 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 CREBBPQ92793 2442 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa5.57□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A096LPK6 155 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 ENO4A6NNW6 628 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC01565O15544 149 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 KINO60870 393 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 DAB1O75553 588 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 ESRRBO95718 433 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 HIST1H2ABP04908 130 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 ASGR1P07306 291 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 MMP2P08253 660 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 HIST1H2ADP20671 130 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 DNASE1P24855 282 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 TACR3P29371 465 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 GYG1P46976 350 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 BMXP51813 675 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 CAPZA1P52907 286 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 BACE1P56817 501 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 CCNA1P78396 465 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 COL10A1Q03692 680 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 DPTQ07507 201 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 PMPCAQ10713 525 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 MEP1BQ16820 701 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 ARMC4Q5T2S8 1044 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 LRIG3Q6UXM1 1119 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 ADCK2Q7Z695 626 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 CEP57Q86XR8 500 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 IQUBQ8NA54 791 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 OR10S1Q8NGN2 331 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 SEPT1Q8WYJ6 367 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 EXOC4Q96A65 974 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 RITA1Q96K30 269 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 INTS14Q96SY0 518 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 ACAT2Q9BWD1 397 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 RTN4RQ9BZR6 473 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATC1LQ9H0A9 340 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 PIGMQ9H3S5 423 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 ADPRHL2Q9NX46 363 aa5.56□□□□□ -1.52
STRADBP1-201ENST00000478954 DNAJB4Q9UDY4 337 aa5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms