RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478722.5

GPHN-203, Transcript of gephyrin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPHN, Length 4,297 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-203ENST00000478722 HDHD2Q9H0R4 259 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 TMLHEQ9NVH6 421 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 SEC14L3Q9UDX4 400 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 MAGEB17A8MXT2 336 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 SERPINA1P01009 418 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 DNTTP04053 509 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 GALTP07902 379 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 SCAPQ12770 1279 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 CARD16Q5EG05 197 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 SLC2A7Q6PXP3 512 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 PTCHD4Q6ZW05 846 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 OR4F6Q8NGB9 312 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 ARPC2O15144 300 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 ZW10O43264 779 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 CAPN15O75808 1086 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 H6PDO95479 791 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 FGF19O95750 216 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 FABP3P05413 133 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 GALK1P51570 392 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 TRIM32Q13049 653 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 CYS1Q717R9 158 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 LRRTM3Q86VH5 581 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 PIK3C3Q8NEB9 887 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 C1orf74Q96LT6 269 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 CGREF1Q99674 301 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 TESMINQ9Y4I5 508 aa13.06□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 A0A1W2PQY0 241 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 AP3D1O14617 1153 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 PDE9AO76083 593 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 IL4RP24394 825 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 GJA5P36382 358 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 AGTR2P50052 363 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 DIO3P55073 304 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 PTSQ03393 145 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 GNA13Q14344 377 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 TMC5Q6UXY8 1006 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 RTP4Q96DX8 246 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 MIPEPQ99797 713 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 SLC22A14Q9Y267 594 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 ASB3Q9Y575 518 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 DGKBQ9Y6T7 804 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 MYH7BA7E2Y1 1941 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 H3BNX3 289 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 TNFRSF11BO00300 401 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 KDELR3O43731 214 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 MFN2O95140 757 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 MAPK12P53778 367 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 RHDQ02161 417 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 ANGPT1Q15389 498 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 TGFBIQ15582 683 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 LDLRAP1Q5SW96 308 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 ZNF678Q5SXM1 525 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 PIK3R6Q5UE93 754 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 CDC73Q6P1J9 531 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 PTPN18Q99952 460 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 OR2AG1Q9H205 316 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 CRISPLD1Q9H336 500 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 LRRC42Q9Y546 428 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 SQORQ9Y6N5 450 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 LAMA4Q16363 1823 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 IFNA16P05015 189 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 PCCBP05166 539 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 ITGB1P05556 798 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 RAP2AP10114 183 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 CAPGP40121 348 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 SLC26A3P40879 764 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 ARSDP51689 593 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 SFT2D3Q587I9 215 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 ARSIQ5FYB1 569 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 AHSA2Q719I0 299 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 OR14C36Q8NHC7 312 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 GIPC3Q8TF64 312 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 RAD51AP1Q96B01 352 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 Q96MT0 163 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 CCDC106Q9BWC9 280 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 FANCEQ9HB96 536 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 C4AP0C0L4 1744 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 LOC730098B7Z3J9 87 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 SAP18O00422 153 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 SDHDO14521 159 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 OR10H2O60403 315 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 UGT2B11O75310 529 aa13.05□□□□□ -0.32
GPHN-203ENST00000478722 POU2F1P14859 743 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms