RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476502.1

TRBV1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV1, Length 284 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF541Q9H0D2 1346 aa2.96□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 TMEM8BA6NDV4 472 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 MAP2K7O14733 419 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 PLPP2O43688 288 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 NDUFS3O75489 264 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 MYOD1P15172 320 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SAT1P21673 171 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 PON1P27169 355 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 MAP2K2P36507 400 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 CAMPP49913 170 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 MMP14P50281 582 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SUOXP51687 545 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 GPR143P51810 404 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 ART1P52961 327 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 GALCP54803 685 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 UBXN2AP68543 259 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 PRAMEP78395 509 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 CXCL9Q07325 125 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SREBF2Q12772 1141 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 GRIK2Q13002 908 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SNTA1Q13424 505 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 HLFQ16534 295 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 CTF1Q16619 201 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SYT16Q17RD7 645 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 C1orf141Q5JVX7 400 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 HECTD3Q5T447 861 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 C18orf63Q68DL7 685 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SIGIRRQ6IA17 410 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 TMEM154Q6P9G4 183 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 CREB3L2Q70SY1 520 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 CREBRFQ8IUR6 639 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 CEP97Q8IW35 865 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 DSELQ8IZU8 1212 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SCML4Q8N228 414 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 RASGEF1CQ8N431 466 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 IL17RCQ8NAC3 791 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SLC44A1Q8WWI5 657 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 WBP2Q969T9 261 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 ORAI1Q96D31 301 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 BICD1Q96G01 975 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 VMP1Q96GC9 406 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 ADGRG7Q96K78 797 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 C3orf30Q96M34 536 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SLC22A12Q96S37 553 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 CMKLR1Q99788 373 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 APOL6Q9BWW8 343 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 GRPEL1Q9HAV7 217 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 OR14J1Q9UGF5 321 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 HACL1Q9UJ83 578 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 PAM16Q9Y3D7 125 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SESN1Q9Y6P5 492 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 CARMIL3Q8ND23 1372 aa2.96□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 CGNL1Q0VF96 1302 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 MAP3K19Q56UN5 1328 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 THSD7BQ9C0I4 1608 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 OR2A25A4D2G3 310 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 LILRA5A6NI73 299 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SMTNL1A8MU46 457 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 ANKRD28O15084 1053 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SPINT2O43291 252 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 TBCAO75347 108 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 ENTPD3O75355 529 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 TPPPO94811 219 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 LMAN1P49257 510 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 AMPHP49418 695 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 RELQ04864 619 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 ACSM2AQ08AH3 577 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 COASYQ13057 564 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 TNFAIP1Q13829 316 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 CALCRLQ16602 461 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 GARNL3Q5VVW2 1013 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 ACSM2BQ68CK6 577 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 GSTA5Q7RTV2 222 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 SMIM29Q86T20 159 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 AACSQ86V21 672 aa2.95□□□□□ -1.94
TRBV1-201ENST00000476502 TMPRSS12Q86WS5 348 aa2.95□□□□□ -1.94
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