RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 SLCO2B1O94956 709 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 AOAHP28039 575 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 PDHA2P29803 388 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 CCR7P32248 378 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 PREPP48147 710 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 ARL4CP56559 192 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 MC2RQ01718 297 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 PRKAA1Q13131 559 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 TUBB2AQ13885 445 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 SPANXN3Q5MJ09 141 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 ARMC6Q6NXE6 501 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 MICALCLQ6ZW33 695 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 OR5K2Q8NHB8 316 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 GSDMBQ8TAX9 411 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 TUBB2BQ9BVA1 445 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 LATS2Q9NRM7 1088 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 TLCD2A6NGC4 264 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 HGFP14210 728 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 ITIH1P19827 911 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 ATP5DP30049 168 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 SLC5A2P31639 672 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 UCNP55089 124 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 GFERP55789 205 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 CRYMQ14894 314 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 HIF1AQ16665 826 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 ZNF470Q6ECI4 717 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 UNC5DQ6UXZ4 953 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 CEACAM20Q6UY09 585 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 OTOAQ7RTW8 1153 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 BMPERQ8N8U9 685 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 KCNE4Q8WWG9 221 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 LCN9Q8WX39 176 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 KLHL6Q8WZ60 621 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 BIRC8Q96P09 236 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 TGM7Q96PF1 710 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 ERP44Q9BS26 406 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 TRIM51Q9BSJ1 452 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 SRMSQ9H3Y6 488 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 HRASLS2Q9NWW9 162 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 WHRNQ9P202 907 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 CDC23Q9UJX2 597 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 ASF1AQ9Y294 204 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 EFCAB7A8K855 629 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 PKMP14618 531 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 MPSTP25325 297 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 SHMT2P34897 504 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 ABCG1P45844 678 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 ITGA8P53708 1063 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 MAPK10P53779 464 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 HSPA14Q0VDF9 509 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 CALCOCO2Q13137 446 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 SNAP47Q5SQN1 464 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 DCAF12Q5T6F0 453 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 CACHD1Q5VU97 1274 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 BROXQ5VW32 411 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 IRGCQ6NXR0 463 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 KIAA0408Q6ZU52 694 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 CENPUQ71F23 418 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 GALNT7Q86SF2 657 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 USP7Q93009 1102 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 RAB17Q9H0T7 212 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 CCDC68Q9H2F9 335 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 SLC39A1Q9NY26 324 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 CDYLQ9Y232 598 aa18.42■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 PMS2P1A4D2B8 440 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 C9orf172C9J069 976 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 GOLGA8KD6RF30 607 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 GOLGA8TH3BQL2 631 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 RASSF9O75901 435 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 S1PR4O95977 384 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 LIPCP11150 499 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 CCL4P13236 92 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 ETV5P41161 510 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 IL11RAQ14626 422 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 BBS9Q3SYG4 887 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 CTSL3PQ5NE16 218 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 KCNMB4Q86W47 210 aa18.41■□□□□ 0.54
SYF2-203ENST00000474160 AMIGO1Q86WK6 493 aa18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms