RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466596.5

HS3ST3B1-202, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

TSL 2

Gene HS3ST3B1, Length 2,808 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-202ENST00000466596 VNN3Q9NY84 501 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SEC24AO95486 1093 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CAPN1P07384 714 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 UROSP10746 265 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MASP1P48740 699 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CDK5R2Q13319 367 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 BEND5Q7L4P6 421 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 BTBD2Q9BX70 525 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 WDR70Q9NW82 654 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CD274Q9NZQ7 290 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.74□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 BCKDKO14874 412 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 VPS4BO75351 444 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GABARAPO95166 117 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DCTP40126 519 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NPTX1Q15818 432 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MS4A13Q5J8X5 152 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GUCA1CO95843 209 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MT-ND2P03891 347 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 EPHA2P29317 976 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 HOXC13P31276 330 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PBX3P40426 434 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 STC1P52823 247 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 VAC14Q08AM6 782 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FXNQ16595 210 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PTPRNQ16849 979 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GCNT7Q6ZNI0 430 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 P2RY8Q86VZ1 359 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 METTL6Q8TCB7 284 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TSPEARQ8WU66 669 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DACH2Q96NX9 599 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.73□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TBX1O43435 398 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SPNP16150 400 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CD40LGP29965 261 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 HOXC8P31273 242 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 HMGCS1Q01581 520 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DGUOKQ16854 277 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 COLEC12Q5KU26 742 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZNF691Q5VV52 312 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 AFMIDQ63HM1 303 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ANKRD46Q86W74 232 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RASSF1Q9NS23 344 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GLTPD2A6NH11 291 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TTC34A8MYJ7 566 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GDF5P43026 501 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TSPY1Q01534 308 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RAD51Q06609 339 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SPATS1Q496A3 300 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FBXL22Q6P050 247 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 OR4K2Q8NGD2 314 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 VMP1Q96GC9 406 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TPK1Q9H3S4 243 aa14.72□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 A0A0D9SEW6 157 aa14.71□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RPP40O75818 363 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DLGAP3O95886 979 aa14.71□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LCKP06239 509 aa14.71□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SERPINB1P30740 379 aa14.71□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GABARAPL2P60520 117 aa14.71□□□□□ -0.05
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms