RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.942e-6■■■□□ 14.6
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SH3BP4-208ENST00000462602 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF806P0C7X5 589 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ALPPL2P10696 532 aa9.18□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 ENGP17813 658 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TFEBP19484 476 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H2ADP20671 130 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP2A7P20853 494 aa9.18□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ACADLP28330 430 aa9.18□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 ABRQ12979 859 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 KIR2DS5Q14953 304 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC153Q494R4 210 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TTMPQ5BVD1 217 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA6LQ8N4H0 392 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM46DQ8NEK8 389 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 RHEBL1Q8TAI7 183 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 MCOLN3Q8TDD5 553 aa9.18□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 C12orf66Q96MD2 445 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC12A9Q9BXP2 914 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 MVB12BQ9H7P6 319 aa9.18□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 YY2O15391 372 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TYROBPO43914 113 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHGA12O60330 932 aa9.17□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 SDC3O75056 442 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SPAG7O75391 227 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ZWINTO95229 277 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF883P0CG24 379 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TAC1P20366 129 aa9.17□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 TSNQ15631 228 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 RPE65Q16518 533 aa9.17□□□□□ -0.94
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SH3BP4-208ENST00000462602 GPSM1Q86YR5 675 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFPM2Q8WW38 1151 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 CXorf40BQ96DE9 158 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-208ENST00000462602 RMDN2Q96LZ7 410 aa9.17□□□□□ -0.94
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