RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435142.1

USP9YP28-201, Transcript of USP9Y pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP28, Length 589 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP28-201ENST00000435142 NEXNQ0ZGT2 675 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 MVPQ14764 893 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 NAA35Q5VZE5 725 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 ATP8B4Q8TF62 1192 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 SGK494Q96LW2 274 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 EPB41L5Q9HCM4 733 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 FBXW11Q9UKB1 542 aa2.76□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A1W2PRB8 838 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 A8MXK9 166 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 MAP2K7O14733 419 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 MGMTP16455 207 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 CA6P23280 308 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 ABCD1P33897 745 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 CCR5P51681 352 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 ZBED6P86452 979 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 CD300CQ08708 224 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 PPFIA1Q13136 1202 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 TAF12Q16514 161 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 KLHL26Q53HC5 615 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF841Q6ZN19 808 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 ANKRD42Q8N9B4 389 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 CHPT1Q8WUD6 406 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 ISCA1Q9BUE6 129 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 RIC8AQ9NPQ8 531 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 MTMR10Q9NXD2 777 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 NDE1Q9NXR1 346 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC6A5Q9Y345 797 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa2.75□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 PIP5K1CO60331 668 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 HPP00738 406 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 THEGLP0DJG4 465 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 CA4P22748 312 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 HERV-K104P61576 105 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 LYSMD4Q5XG99 296 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 NHLRC1Q6VVB1 395 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 GSDMBQ8TAX9 411 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 APOPT1Q96IL0 206 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 SCLT1Q96NL6 688 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 CAPN7Q9Y6W3 813 aa2.74□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF840PA6NDX5 716 aa2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM220BPB1ANY3 271 aa2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 SHISA9B4DS77 424 aa2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 DFFBO76075 338 aa2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 KIF6Q6ZMV9 814 aa2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 TPRG1Q6ZUI0 275 aa2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 TSPAN33Q86UF1 283 aa2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 CEP97Q8IW35 865 aa2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 KIRREL3Q8IZU9 778 aa2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 MGME1Q9BQP7 344 aa2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 MED20Q9H944 212 aa2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 SARDHQ9UL12 918 aa2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 MKLN1Q9UL63 735 aa2.73□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 E9PI62 339 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 PI4K2BG5E9Z4 385 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 HSD3B1P14060 373 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 CAPGP40121 348 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 GAGE2BQ13066 116 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 MEP1AQ16819 746 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 GAGE2EQ4V326 116 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 LRIF1Q5T3J3 769 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 GAGE2AQ6NT46 116 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 OR8K5Q8NH50 307 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 SLA2Q9H6Q3 261 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 A4GALTQ9NPC4 353 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 GAGE2DQ9UEU5 116 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 TSPYL4Q9UJ04 414 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 TSPAN16Q9UKR8 245 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 IKZF3Q9UKT9 509 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 GPR52Q9Y2T5 361 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa2.72□□□□□ -1.97
USP9YP28-201ENST00000435142 H0Y9J4 135 aa2.71□□□□□ -1.98
USP9YP28-201ENST00000435142 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
USP9YP28-201ENST00000435142 DAB1O75553 588 aa2.71□□□□□ -1.98
USP9YP28-201ENST00000435142 SLCO2B1O94956 709 aa2.71□□□□□ -1.98
USP9YP28-201ENST00000435142 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
USP9YP28-201ENST00000435142 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms