RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
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RBM39-211ENST00000426951 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
RBM39-211ENST00000426951 ECHDC1Q9NTX5 307 aa3.93□□□□□ -1.78
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