RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEB17A8MXT2 336 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 WNT7AO00755 349 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CLDN4O14493 209 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC7A4O43246 635 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PRAMEF10O60809 474 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKD3O94806 890 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 NOL4O94818 638 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP2K5Q13163 448 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 HSDL1Q3SXM5 330 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF311Q5JNZ3 666 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TSTD2Q5T7W7 516 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PAOXQ6QHF9 649 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 NSMCE3Q96MG7 304 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 COQ10BQ9H8M1 238 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf109Q9NX04 203 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP97Q9P2B7 532 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CXCR6O00574 342 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TOR1BO14657 336 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PIP5K1BO14986 540 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 MATN4O95460 622 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 VIPP01282 170 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 DNASE1L1P49184 302 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 VBP1P61758 197 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS14P62263 151 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 GNA12Q03113 381 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ADGRE1Q14246 886 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PRR23CQ6ZRP0 262 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 UNC5BQ8IZJ1 945 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 OR5T3Q8NGG3 340 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ING5Q8WYH8 240 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CNPPD1Q9BV87 410 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHA1Q9HB21 404 aa10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 E9PAM4 449 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MID1O15344 667 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 NPHS1O60500 1241 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 STBD1O95210 358 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 NCK1P16333 377 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TACR2P21452 398 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PNLIPRP1P54315 467 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF2H2Q13888 395 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ADNP2Q6IQ32 1131 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ALKBH2Q6NS38 261 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CPNE9Q8IYJ1 553 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE2J2Q8N2K1 259 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 OR4C6Q8NH72 309 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MARCH7Q9H992 704 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CD320Q9NPF0 282 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GMIPQ9P107 970 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D14Q9P2M4 693 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SALL4Q9UJQ4 1053 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GVM2 712 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TCAF2A6NFQ2 919 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GADD45GO95257 159 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 RAP2AP10114 183 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 CREB1P16220 341 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 IDH3AP50213 366 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP3R1P63098 170 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ACSBG2Q5FVE4 666 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC9A4Q6AI14 798 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR153Q6NV75 609 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 ABHD15Q6UXT9 468 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 SATL1Q86VE3 508 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GALNT15Q8N3T1 639 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 C4orf32Q8N8J7 132 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf127Q8N9H9 656 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 FEM1CQ96JP0 617 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 OR51V1Q9H2C8 321 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 EBF3Q9H4W6 596 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 AMBNQ9NP70 447 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 UPB1Q9UBR1 384 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJB9Q9UBS3 223 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 TCHHQ07283 1943 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MYH15Q9Y2K3 1946 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2AG2A6NM03 316 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 MATN3O15232 486 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GLUD1P00367 558 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GNAZP19086 355 aa10.83□□□□□ -0.68
EFTUD2-202ENST00000426333 GNALP38405 381 aa10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms