RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 HK3P52790 923 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 CTSCP53634 463 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 AQP5P55064 265 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 PFN3P60673 137 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 CTBSQ01459 385 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 LRP8Q14114 963 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 TBCCQ15814 346 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 CGB2Q6NT52 195 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 EPGNQ6UW88 154 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 WASH2PQ6VEQ5 465 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 C11orf74Q86VG3 221 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 IQCHQ86VS3 1027 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 LSMEM2Q8N112 164 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 RAB42Q8N4Z0 105 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 PJA1Q8NG27 643 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 C10orf82Q8WW14 230 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 RAD51AP1Q96B01 352 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 RILPQ96NA2 401 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM237Q96Q45 408 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 EGFL8Q99944 293 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 GSTO2Q9H4Y5 243 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 TBC1D17Q9HA65 648 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 WASH6PQ9NQA3 447 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 SAR1AQ9NR31 198 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ARL15Q9NXU5 204 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 OPTCQ9UBM4 332 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 POLG2Q9UHN1 485 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 PDE10AQ9Y233 779 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa9.4□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 C5orf42Q9H799 3197 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 REV3LO60673 3130 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0G2JND7 137 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PPC4 97 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 NEMP2A6NFY4 417 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 METTL12A8MUP2 240 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 HGSO14964 777 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 AZIN1O14977 448 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 SLC22A2O15244 555 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 UGDHO60701 494 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ENO1P06733 434 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 SERPINA6P08185 405 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 EBLN1P0CF75 366 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 UROSP10746 265 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 EPB42P16452 691 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 IDSP22304 550 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ACADLP28330 430 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFS1P28331 727 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 BLKP51451 505 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 THOP1P52888 689 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ZXDAP98168 799 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ABRQ12979 859 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 IFT88Q13099 833 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 NFATC4Q14934 902 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 PYCR3Q53H96 274 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 SH2D4BQ5SQS7 431 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 FAM91A1Q658Y4 838 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ANO7Q6IWH7 933 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZS52 159 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC121Q6ZUS5 278 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ACAD11Q709F0 780 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 C11orf96Q7Z7L8 435 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 CUZD1Q86UP6 607 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 FAM124AQ86V42 546 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF547Q8IVP9 402 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 PELI3Q8N2H9 469 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF781Q8N8C0 355 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ZFPM2Q8WW38 1151 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 BMFQ96LC9 184 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 WDR92Q96MX6 357 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF382Q96SR6 550 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 LGR4Q9BXB1 951 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 SLC6A17Q9H1V8 727 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 RABEP2Q9H5N1 569 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 PNPOQ9NVS9 261 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 WWOXQ9NZC7 414 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 HEY2Q9UBP5 337 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa9.39□□□□□ -0.91
HDLBP-211ENST00000425989 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms