RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
PTPRC-205ENST00000391970 A0A1W2PPQ1 181 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ASPDHA6ND91 283 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 MEIS2O14770 477 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 RPN1P04843 607 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 H1F0P07305 194 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 OR52Z1P0C646 297 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 T-ENOLP0DO92 83 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 CYP11B2P19099 503 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 HSPA4P34932 840 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 GP5P40197 560 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 IL15P40933 162 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 SLC9A3P48764 834 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 RPL24P83731 157 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 PPARDQ03181 441 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 PRKCZQ05513 592 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 RBPJQ06330 500 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ACSM1Q08AH1 577 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 MFAP5Q13361 173 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF273Q14593 569 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 DUOXA1Q1HG43 343 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 HECTD3Q5T447 861 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 LRCH2Q5VUJ6 765 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 PRR27Q6MZM9 219 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 PRSS57Q6UWY2 283 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 LINGO4Q6UY18 593 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 MFN1Q8IWA4 741 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 FAM114A1Q8IWE2 563 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 OR5M8Q8NGP6 311 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 SECTM1Q8WVN6 248 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ROBO4Q8WZ75 1007 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 IGSF21Q96ID5 467 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 MUS81Q96NY9 551 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 DUX5Q96PT3 197 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 SPAG5Q96R06 1193 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ADPGKQ9BRR6 497 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ACKR4Q9NPB9 350 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 MYNNQ9NPC7 610 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 PFDN4Q9NQP4 134 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 STK26Q9P289 416 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF112Q9UJU3 913 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 A0A1W2PS18 150 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 HYKKA2RU49 373 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 PRR32B1ATL7 298 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 PRAC2D3DTV9 90 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 SYNGR3O43761 229 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 BAG4O95429 457 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 PENKP01210 267 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ACP2P11117 423 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 CKMT2P17540 419 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 CBLP22681 906 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 MPZP25189 248 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 HOXC8P31273 242 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 RBP5P82980 135 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 COASYQ13057 564 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 GAGE5Q13069 117 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 GAGE6Q13070 117 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 FHL1Q13642 323 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 SIRPB2Q5JXA9 342 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 DET1Q7L5Y6 550 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 DSG4Q86SJ6 1040 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 SLC9B2Q86UD5 537 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 METTL23Q86XA0 190 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 NAGSQ8N159 534 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 CRYBG2Q8N1P7 616 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 IQUBQ8NA54 791 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 SLC4A11Q8NBS3 891 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 PPFIBP2Q8ND30 876 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 SPSB1Q96BD6 273 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 C17orf77Q96MU5 243 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 SFXN2Q96NB2 322 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF558Q96NG5 402 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 GBP5Q96PP8 586 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 LRRC1Q9BTT6 524 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 VN1R1Q9GZP7 353 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 EVA1AQ9H8M9 152 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ZWILCHQ9H900 591 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 Q9N2K0 584 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 ABCF3Q9NUQ8 709 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 MRGBPQ9NV56 204 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRC-205ENST00000391970 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
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