RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384508.1

RNU6-110P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 110, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-110P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-110P-201ENST00000384508 JAK1P23458 1154 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ITGB8P26012 769 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 HOXD10P28358 340 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 SLC6A6P31641 620 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ARRB2P32121 409 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 DCTDP32321 178 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TNFSF8P32971 234 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CA8P35219 290 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PCGF2P35227 344 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 RFC4P35249 363 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PTGER4P35408 488 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 DEKP35659 375 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 DLSTP36957 453 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TXKP42681 527 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 MMP13P45452 471 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TRPC1P48995 793 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PTH2RP49190 550 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CENPAP49450 140 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 RGS7P49802 495 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 MXI1P50539 228 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CYP2J2P51589 502 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ARSEP51690 589 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 SNU13P55769 128 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 MTCP1P56278 107 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CLDN15P56746 228 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CLDN20P56880 219 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 GMFBP60983 142 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PPP2CBP62714 309 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PPP2CAP67775 309 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 FKBP1BP68106 108 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZXDBP98169 803 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 XIAPP98170 497 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TNFRSF17Q02223 184 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 SP3Q02447 781 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 LIPEQ05469 1076 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 GOLGA8FQ08AF8 430 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 DMPKQ09013 629 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZNF415Q09FC8 603 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 FOXI1Q12951 378 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 IL24Q13007 206 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PLD1Q13393 1074 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 GPM6BQ13491 265 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 RIPK1Q13546 671 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 DPYSQ14117 519 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 VEZF1Q14119 521 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 GAMTQ14353 236 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 GALNT3Q14435 633 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 MELKQ14680 651 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 LPIN1Q14693 890 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PTPRCAPQ14761 206 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ICAM4Q14773 271 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ARHGEF6Q15052 776 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 SHBQ15464 509 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 INAQ16352 499 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 KCNMB1Q16558 191 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 UGP2Q16851 508 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 SYT16Q17RD7 645 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TCTN1Q2MV58 587 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ALKBH6Q3KRA9 238 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ADPRMQ3LIE5 342 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 NADK2Q4G0N4 442 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 IFI44LQ53G44 452 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 RAB6CQ53S08 254 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CAVIN4Q5BKX8 364 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 MDH1BQ5I0G3 518 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TCTE1Q5JU00 501 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PCID2Q5JVF3 399 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 SPDYCQ5MJ68 293 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 NT5DC1Q5TFE4 455 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ATF7IP2Q5U623 682 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 SFMBT2Q5VUG0 894 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TMEM268Q5VZI3 342 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 NCR3LG1Q68D85 454 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 KIAA0895LQ68EN5 471 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 KRT39Q6A163 491 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 IGFL4Q6B9Z1 124 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ATL3Q6DD88 541 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PM20D1Q6GTS8 502 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 RAET1GQ6H3X3 334 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 HMBOX1Q6NT76 420 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CEP85Q6P2H3 762 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 NEK5Q6P3R8 708 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 SLC39A4Q6P5W5 647 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 FOXR2Q6PJQ5 311 aa0.7□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms