RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM51Q9BSJ1 452 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 HRH4Q9H3N8 390 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 FLRT3Q9NZU0 649 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 RIPK3Q9Y572 518 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 NOTCH3Q9UM47 2321 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRR32B1ATL7 298 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 E9PI62 339 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 F5H0A9 414 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP6V0E1O15342 81 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 SSX4O60224 188 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 MITFO75030 526 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRLRP16471 622 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 CEBPBP17676 345 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 TYMPP19971 482 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 SP100P23497 879 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 HADHAP40939 763 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 MFAP4P55083 255 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPR17Q13304 367 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 MELKQ14680 651 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 P2RY6Q15077 328 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 TEAD2Q15562 447 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 LPAL2Q16609 132 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 MDH1BQ5I0G3 518 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAAP20Q6NZ36 180 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q6ZSR9 355 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM114A1Q8IWE2 563 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF440Q8IYI8 595 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPFIBP2Q8ND30 876 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF128Q8TEB7 428 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZFAND2BQ8WV99 257 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 CEP295NLQ96MC4 621 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR6C1Q96RD1 312 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 VGLL1Q99990 258 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 SYT15Q9BQS2 421 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 SYT11Q9BT88 431 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 RTN4RQ9BZR6 473 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 P2RY12Q9H244 342 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAK5Q9P286 719 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 HACL1Q9UJ83 578 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMCHD1A6NHR9 2005 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PR77 199 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDRT15L2A8MXV6 281 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 E9PQ18 207 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZWINTO95229 277 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 GARSP41250 739 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 DCAF7P61962 342 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRKCZQ05513 592 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 DMPKQ09013 629 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 XKR6Q5GH73 641 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM180BQ6P0A1 224 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM65Q6PJ69 517 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPEM1Q8N4L4 309 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF614Q8N883 585 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 OLIG1Q8TAK6 271 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 HPSE2Q8WWQ2 592 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 MOCOSQ96EN8 888 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 C18orf12Q96KH6 178 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 AGAP3Q96P47 875 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 PYGO2Q9BRQ0 406 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 C16orf70Q9BSU1 422 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 CABLES2Q9BTV7 478 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 FNDC11Q9BVV2 318 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDK19Q9BWU1 502 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 A4GALTQ9NPC4 353 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM181Q9P2C4 612 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 RHCGQ9UBD6 479 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 HYKKA2RU49 373 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 B4DLN1 442 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 VILLO15195 856 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 XRCC3O43542 346 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 DCXO43602 365 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTP4A3O75365 173 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 VPREB1P12018 145 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 TM4SF1P30408 202 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 GABRA5P31644 462 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAGEA11P43364 429 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNX16P57768 344 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 CX3CL1P78423 397 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 IRF3Q14653 427 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-38P-201ENST00000384085 GRTP1Q5TC63 336 aa2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms