RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377244.7

SNX15-202, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX15, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-202ENST00000377244 GPSM1Q86YR5 675 aa24.83■■□□□ 1.57
SNX15-202ENST00000377244 WWP1Q9H0M0 922 aa24.83■■□□□ 1.57
SNX15-202ENST00000377244 DPEP2Q9H4A9 486 aa24.83■■□□□ 1.57
SNX15-202ENST00000377244 CIDEBQ9UHD4 219 aa24.83■■□□□ 1.57
SNX15-202ENST00000377244 ADAM21Q9UKJ8 722 aa24.83■■□□□ 1.57
SNX15-202ENST00000377244 SNX2O60749 519 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 TNFP01375 233 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 BGNP21810 368 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 TGFBIQ15582 683 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 LPAL2Q16609 132 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 FRA10AC1Q70Z53 315 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 NUDCD3Q8IVD9 361 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PHACTR4Q8IZ21 702 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PHF21BQ96EK2 531 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 RMDN2Q96LZ7 410 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 A8MT66 165 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 GUCA1CO95843 209 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 ACADLP28330 430 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 BDKRB1P46663 353 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 NXPH1P58417 271 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 RPA4Q13156 261 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 CES4AQ5XG92 561 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 RDH11Q8TC12 318 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PRDM8Q9NQV8 689 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PDE10AQ9Y233 779 aa24.82■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 A0A1B0GVT2 93 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 ARHGEF33A8MVX0 844 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 GFYI3L273 518 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 VILLO15195 856 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 EML2O95834 649 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 ACTR1BP42025 376 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 ACTR1AP61163 376 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 CCSMST1Q4G0I0 132 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PRR23BQ6ZRT6 265 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PDZD3Q86UT5 571 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 NRROSQ86YC3 692 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 CKAP2Q8WWK9 683 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PIGKQ92643 395 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 OXSMQ9NWU1 459 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 TBC1D29Q9UFV1 150 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PILRBQ9UKJ0 227 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PI4KAP42356 2102 aa24.81■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 KLHL33A6NCF5 533 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 NEFHP12036 1026 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 JUNDP17535 347 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 CNR2P34972 360 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 C1orf61Q13536 156 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PFKFB4Q16877 469 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 RASGRP3Q8IV61 690 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 SIRPGQ9P1W8 387 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 MID2Q9UJV3 735 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 OARD1Q9Y530 152 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PDZK1P1A8MUH7 402 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PRR33A8MZF0 331 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 C8GP07360 202 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 SLC35G4P0C7Q5 338 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 GFAPP14136 432 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 C21orf59P57076 290 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 LRP8Q14114 963 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 CHI3L2Q15782 390 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 LRRC61Q9BV99 259 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 SLC12A9Q9BXP2 914 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 CAPS2Q9BXY5 557 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 CD274Q9NZQ7 290 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 ACSL5Q9ULC5 683 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 CACNA1EQ15878 2313 aa24.8■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 BIRC5O15392 142 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 FFAR2O15552 330 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 TAC1P20366 129 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 IDSP22304 550 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 CLCA4Q14CN2 919 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PDK4Q16654 411 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PRRT3Q5FWE3 981 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PHC3Q8NDX5 983 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PARVBQ9HBI1 364 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa24.79■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 TMEM131Q92545 1883 aa24.78■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 A0A1B0GTW7 788 aa24.78■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 LRRC14BA6NHZ5 514 aa24.78■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 SYCE1LA8MT33 242 aa24.78■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 KCNJ13O60928 360 aa24.78■■□□□ 1.56
SNX15-202ENST00000377244 SMIM24O75264 130 aa24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms