RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376227.3

CCDC22-201, Transcript of coiled-coil domain containing 22, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC22, Length 2,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22-201ENST00000376227 E2F6O75461 281 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 RETP07949 1114 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 IL7RP16871 459 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 DGKAP23743 735 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 HSPA7P48741 367 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 MAPK10P53779 464 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 PLA2G16P53816 162 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 RAD23AP54725 363 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 FAM189BP81408 668 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 DUSP4Q13115 394 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 IL18R1Q13478 541 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 NR1D2Q14995 579 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 SPESP1Q6UW49 350 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 ABI1Q8IZP0 508 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 TANKQ92844 425 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 NCLNQ969V3 563 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 MBOAT4Q96T53 435 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 SMURF2Q9HAU4 748 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 ASIC5Q9NY37 505 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 WWOXQ9NZC7 414 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 IL17CQ9P0M4 197 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 BAG5Q9UL15 447 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 GBF1Q92538 1859 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC22-201ENST00000376227 GUCA1CO95843 209 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 PGRP06401 933 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 TFPTP0C1Z6 253 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 OCA2Q04671 838 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 PTGR1Q14914 329 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 RGS21Q2M5E4 152 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 NCEH1Q6PIU2 408 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 MICU2Q8IYU8 434 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 SYT17Q9BSW7 474 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 CIPCQ9C0C6 399 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 COQ6Q9Y2Z9 468 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 HS6ST1O60243 411 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 NOBOXO60393 691 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 HMGCLP35914 325 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 HUNKP57058 714 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 KCNAB2Q13303 367 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 MEP1AQ16819 746 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 ATG9BQ674R7 924 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 RBFAQ8N0V3 343 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 LIX1Q8N485 282 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 FAM86B1Q8N7N1 296 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 TRIB2Q92519 343 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 ULK4Q96C45 1275 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 B3GALT6Q96L58 329 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 SEC22BO75396 215 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 PRKD3O94806 890 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 EBLN1P0CF75 366 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 PORP16435 677 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 NRIP1P48552 1158 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 HECTD3Q5T447 861 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 GPR149Q86SP6 731 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 SLC15A4Q8N697 577 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 OR52E6Q96RD3 313 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 CD244Q9BZW8 370 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 CLMPQ9H6B4 373 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 CWH43Q9H720 699 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 KLQ9UEF7 1012 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 ALDH2P05091 517 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 COL6A1P12109 1028 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC22-201ENST00000376227 IL1RNP18510 177 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.5 ms