RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 MTERF3Q96E29 417 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 PHF21BQ96EK2 531 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM19Q96HH6 336 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF778Q96MU6 729 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPATA33Q96N06 139 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 FEVQ99581 238 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 INPP5KQ9BT40 448 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 KATNB1Q9BVA0 655 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 FUT8Q9BYC5 575 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 IL25Q9H293 177 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRPV4Q9HBA0 871 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 Q9N2K0 584 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 STK26Q9P289 416 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 POLLQ9UGP5 575 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDH7Q9ULB5 785 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNF150Q9ULK6 438 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNS2Q9ULS6 477 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 LIPT1Q9Y234 373 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNK7Q9Y2U2 307 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 IGSF1Q8N6C5 1336 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF521Q96K83 1311 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 HYKKA2RU49 373 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM90A10PA6NDY2 464 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 CD8B2A6NJW9 211 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 PROB1E7EW31 1015 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNHIT1O43257 154 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 AP5Z1O43299 807 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 GOSR1O95249 250 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACSL3O95573 720 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 BAG2O95816 211 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 WDPCPO95876 746 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 IGHV2-70P01814 119 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRSS2P07478 247 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 CSN3P07498 182 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 CSF2RAP15509 400 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 TCF4P15884 667 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 GNAZP19086 355 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNJ4P48050 445 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 LHX1P48742 406 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 PEX5P50542 639 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF81P51508 661 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBASH3AP57075 661 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTENP60484 403 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 RELQ04864 619 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 DLG1Q12959 904 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRKAA1Q13131 559 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 CUL3Q13618 768 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 GTF2H2Q13888 395 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 UGCGQ16739 394 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC142Q17RM4 750 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 SFMBT2Q5VUG0 894 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR7E24Q6IFN5 339 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 MFSD12Q6NUT3 480 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLBD1Q6P4A8 553 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 KLC3Q6P597 504 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF549Q6P9A3 640 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 IYDQ6PHW0 289 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLXDC2Q6UX71 529 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 LINC00696Q6ZRV3 163 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPATA21Q7Z572 469 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMPRSS11BQ86T26 416 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 SATL1Q86VE3 508 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTOV1Q86YD1 416 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM219AQ8IW50 185 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM114A1Q8IWE2 563 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADHFE1Q8IWW8 467 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 CARNMT1Q8N4J0 409 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF611Q8N823 705 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 NHLRC2Q8NBF2 726 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 MSANTD4Q8NCY6 345 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 SSMEM1Q8WWF3 244 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-655P-201ENST00000362858 SEMA4DQ92854 862 aa2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms