RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355560.4

CLK2-201, Transcript of CDC like kinase 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CLK2, Length 2,120 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2-201ENST00000355560 SEC13P55735 322 aa25.14■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 DPTQ07507 201 aa25.14■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ART3Q13508 389 aa25.14■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 OGFOD2Q6N063 350 aa25.14■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 PGM2L1Q6PCE3 622 aa25.14■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CCT7Q99832 543 aa25.14■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 MID1O15344 667 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 EPB42P16452 691 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 ACADVLP49748 655 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 HTR6P50406 440 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
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CLK2-201ENST00000355560 CCM2Q9BSQ5 444 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 BRWD1Q9NSI6 2320 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 GPX3P22352 226 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 CST6Q15828 149 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 IL27RAQ6UWB1 636 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 TCAIMQ8N3R3 496 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 AADATQ8N5Z0 425 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 EFCAB3Q8N7B9 438 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 CFAP61Q8NHU2 1237 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 STMN2Q93045 179 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 MSLNLQ96KJ4 702 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 RIC8BQ9NVN3 520 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 NDE1Q9NXR1 346 aa25.13■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 HMOX2P30519 316 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 TIE1P35590 1138 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 PREPP48147 710 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 NME5P56597 212 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 STX5Q13190 355 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 MMEL1Q495T6 779 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 PGAM4Q8N0Y7 254 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 MIER2Q8N344 545 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 MCOLN3Q8TDD5 553 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 GLMNQ92990 594 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 HBEGFQ99075 208 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 SLC25A23Q9BV35 468 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 OR2AG1Q9H205 316 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 DCLRE1BQ9H816 532 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 ATG2BQ96BY7 2078 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 KRT87PA6NCN2 255 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 K7EQS6 105 aa25.12■■□□□ 1.61
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CLK2-201ENST00000355560 GGT5P36269 586 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 PIK3CGP48736 1102 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 HNMTP50135 292 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 ACTR3P61158 418 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 GSTM4Q03013 218 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 HTR4Q13639 388 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 NLRP8Q86W28 1048 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 HPS6Q86YV9 775 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 FBXW8Q8N3Y1 598 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 SLC32A1Q9H598 525 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 EPHX3Q9H6B9 360 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 WDR41Q9HAD4 459 aa25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 MATN4O95460 622 aa25.11■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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CLK2-201ENST00000355560 AP1S2P56377 157 aa25.11■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 E2F5Q15329 346 aa25.11■■□□□ 1.61
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CLK2-201ENST00000355560 NTMT1Q9BV86 223 aa25.11■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 LMCD1Q9NZU5 365 aa25.11■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 EPS15L1Q9UBC2 864 aa25.11■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 SLC5A10A0PJK1 596 aa25.1■■□□□ 1.61
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CLK2-201ENST00000355560 MTTPP55157 894 aa25.1■■□□□ 1.61
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CLK2-201ENST00000355560 GSTA3Q16772 222 aa25.1■■□□□ 1.61
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CLK2-201ENST00000355560 Q6ZSR9 355 aa25.1■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa25.1■■□□□ 1.61
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CLK2-201ENST00000355560 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa25.1■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 FUNDC1Q8IVP5 155 aa25.1■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa25.1■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 SMRP1Q8NCR6 262 aa25.1■■□□□ 1.61
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CLK2-201ENST00000355560 EBLN1P0CF75 366 aa25.1■■□□□ 1.61
CLK2-201ENST00000355560 TNFRSF4P43489 277 aa25.1■■□□□ 1.61
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