RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 TPH1P17752 444 aa20.53■□□□□ 0.88
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SOCS1-201ENST00000332029 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.49■□□□□ 0.87
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SOCS1-201ENST00000332029 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.49■□□□□ 0.87
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SOCS1-201ENST00000332029 POMT2Q9UKY4 750 aa20.49■□□□□ 0.87
SOCS1-201ENST00000332029 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa20.48■□□□□ 0.87
SOCS1-201ENST00000332029 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.48■□□□□ 0.87
SOCS1-201ENST00000332029 MEN1O00255 615 aa20.48■□□□□ 0.87
SOCS1-201ENST00000332029 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SOCS1-201ENST00000332029 CDH3P22223 829 aa20.48■□□□□ 0.87
SOCS1-201ENST00000332029 PTGIRP43119 386 aa20.48■□□□□ 0.87
SOCS1-201ENST00000332029 ABRQ12979 859 aa20.48■□□□□ 0.87
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