RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294161.10

TTC9C-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC9C, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9C-201ENST00000294161 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 C5orf42Q9H799 3197 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 MYO9BQ13459 2157 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 DHRS12A0PJE2 317 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ZNF839A8K0R7 811 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 A8MX80 341 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 QSOX1O00391 747 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ULK1O75385 1050 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 KRT6AP02538 564 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 KRT6BP04259 564 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 UGT2B4P06133 528 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 BMP2P12643 396 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 TCF3P15923 654 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 HOXA9P31269 272 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 VIPR1P32241 457 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 KRT6CP48668 564 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SPINT3P49223 89 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 HNMTP50135 292 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 PTSQ03393 145 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SP140Q13342 867 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 TLR1Q15399 786 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 UGT2A3Q6UWM9 527 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 HID1Q8IV36 788 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SFRP1Q8N474 314 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ANKFN1Q8N957 763 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SLC45A3Q96JT2 553 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 CDK15Q96Q40 435 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ALG2Q9H553 416 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SMOXQ9NWM0 555 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.5□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SCN8AQ9UQD0 1980 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 C5orf67F2Z3F1 127 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 AKAP10O43572 662 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 AP2A2O94973 939 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SLC2A4P14672 509 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 TYRP14679 529 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 JAK1P23458 1154 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 DCDC1P59894 354 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 TEAD2Q15562 447 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 IMPG1Q17R60 797 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 TBCELQ5QJ74 424 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 GALNT4Q8N4A0 578 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 LRTOMTQ8WZ04 291 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SLCO4A1Q96BD0 722 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 LRCH3Q96II8 777 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SLC32A1Q9H598 525 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ASIC5Q9NY37 505 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 DPP7Q9UHL4 492 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.49□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ZNF197O14709 1029 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 NUAK1O60285 661 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 GMNNO75496 209 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 TNFAIP8O95379 198 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 CLDN9O95484 217 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 CYP2A7P20853 494 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ATP6V1B2P21281 511 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 HTR1EP28566 365 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 AKT1P31749 480 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 GGT5P36269 586 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 CASP2P42575 452 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 GNPDA1P46926 289 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 RPIAP49247 311 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 UBE3AQ05086 875 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 LIPEQ05469 1076 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 PHKG1Q16816 387 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 HCAR2Q8TDS4 363 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 VPS33AQ96AX1 596 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ZNF597Q96LX8 424 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 TMEM79Q9BSE2 394 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 PARVBQ9HBI1 364 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 ARL15Q9NXU5 204 aa14.48□□□□□ -0.09
TTC9C-201ENST00000294161 MARK1Q9P0L2 795 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms