RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 CAPN15O75808 1086 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 NT5EP21589 574 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SMCO1Q147U7 214 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF311Q5JNZ3 666 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SLC30A8Q8IWU4 369 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 TOP1MTQ969P6 601 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PI15O43692 258 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 IRF9Q00978 393 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO42Q6P3S6 717 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SNX20Q7Z614 316 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 HID1Q8IV36 788 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF570Q96NI8 536 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM209Q96SK2 561 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP26Q9BV47 211 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CPQQ9Y646 472 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CHRNA4P43681 627 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CBX3Q13185 183 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 DAG1Q14118 895 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 KCNJ11Q14654 390 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC20AQ6ZU45 233 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ESAMQ96AP7 390 aa20.81■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CDH1P12830 882 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 IGFALSP35858 605 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CYP4F8P98187 520 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PPP2R2BQ00005 443 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 FAM91A1Q658Y4 838 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 USP30Q70CQ3 517 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 HAVCR1Q96D42 359 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CDADC1Q9BWV3 514 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SP140LQ9H930 580 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CD84Q9UIB8 345 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35G6P0C7Q6 338 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 NR4A1P22736 598 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJB1P25685 340 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 EI24O14681 340 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 EPHX1P07099 455 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PSMD8P48556 350 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 TMCO6Q96DC7 493 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R7Q9NYW3 318 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 HCN1O60741 890 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF358Q9NW07 568 aa20.8■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN4O14493 209 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 OR1F1O43749 312 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 REM1O75628 298 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 AKIRIN2Q53H80 203 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2U1Q7Z449 544 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 FAM124AQ86V42 546 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ATCAYQ86WG3 371 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf34Q96MH7 638 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 RGS20O76081 388 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 FAM25EA8MYX2 175 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 FFAR2O15552 330 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 GIMD1P0DJR0 217 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PRPS1L1P21108 318 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 HSF2Q03933 536 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 HSPB3Q12988 150 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL22Q53GT1 634 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 BTN2A1Q7KYR7 527 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 YAP1P46937 504 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CNPY1Q3B7I2 92 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM198Q66K66 360 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 MED28Q9H204 178 aa20.79■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CCNFP41002 786 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 E2F2Q14209 437 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 FAAH2Q6GMR7 532 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ART5Q96L15 291 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf21Q9H246 121 aa20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms