RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 RELTQ969Z4 430 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 C12orf66Q96MD2 445 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 SYT11Q9BT88 431 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.64□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MYO7BQ6PIF6 2116 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 FER1L5A0AVI2 2057 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 LGALS16A8MUM7 142 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 E2F3O00716 465 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ZNF749O43361 778 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 COX6B1P14854 86 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 HLA-DPA1P20036 260 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 NFE2L1Q14494 772 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ZNF789Q5FWF6 425 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 VWA2Q5GFL6 755 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 TMEM220Q6QAJ8 160 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MNS1Q8NEH6 495 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 OR4E2Q8NGC2 313 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 OR2Y1Q8NGV0 311 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 NACC2Q96BF6 587 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PTERQ96BW5 349 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PPM1MQ96MI6 270 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 GBP5Q96PP8 586 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 NDOR1Q9UHB4 597 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 POMT2Q9UKY4 750 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ACSL5Q9ULC5 683 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MYO6Q9UM54 1294 aa11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 NF1P21359 2839 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 GSAPA4D1B5 854 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 KLHL33A6NCF5 533 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 NDUFS1P28331 727 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CASQ1P31415 396 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 SSR1P43307 286 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 DCDP81605 110 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 TLR1Q15399 786 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 HIF1AQ16665 826 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 HADHQ16836 314 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 FAM180AQ6UWF9 173 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 NXPE1Q8N323 547 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CEP112Q8N8E3 955 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 DTX3LQ8TDB6 740 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 AGAP4Q96P64 663 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 TRIB3Q96RU7 358 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 WWP1Q9H0M0 922 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa11.62□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 NAV3Q8IVL0 2385 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CCDC66A2RUB6 948 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 OR2AG2A6NM03 316 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 AGPSO00116 658 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 KIF5CO60282 957 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MFAP3LO75121 409 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 JRKO75564 520 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CD48P09326 243 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 SLC35G4P0C7Q5 338 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PYGMP11217 842 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 HTR1EP28566 365 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 LMAN1P49257 510 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 LONRF2Q1L5Z9 754 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 FIGNQ5HY92 759 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MTFR2Q6P444 385 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 NT5DC3Q86UY8 548 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 MAP7D3Q8IWC1 876 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 BCORP1Q8N888 145 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 NIPA2Q8N8Q9 360 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 KCTD6Q8NC69 237 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 FAM71BQ8TC56 605 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 LCN9Q8WX39 176 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 HDAC11Q96DB2 347 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 CNDP1Q96KN2 507 aa11.61□□□□□ -0.55
SPC25-201ENST00000282074 SLX1AQ9BQ83 275 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms