RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 IFT43Q96FT9 208 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 HIC2Q96JB3 615 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 LRGUKQ96M69 825 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF599Q96NL3 588 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 BTBD9Q96Q07 612 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CENPKQ9BS16 269 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CAB39LQ9H9S4 337 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 POPDC3Q9HBV1 291 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM30AQ9NV96 361 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PLK2Q9NYY3 685 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 UBP1Q9NZI7 540 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 XPR1Q9UBH6 696 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TMCO1Q9UM00 188 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 NBASA2RRP1 2371 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GTQ1 180 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC189A1A4V9 331 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 AIM2O14862 343 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 DLX3O60479 287 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 RAMP2O60895 175 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 VPS4BO75351 444 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT34O76011 436 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 EPOP01588 193 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 HLA-DQB2P05538 268 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ACADMP11310 421 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 GP1BBP13224 206 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 UQCRBP14927 111 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 MPSTP25325 297 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 YWHAQP27348 245 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 OXTRP30559 389 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC1A2P43004 574 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 NUDT2P50583 147 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP4BP51164 291 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 C21orf59P57076 290 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 STX1BP61266 288 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 GABREP78334 506 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 IL10RBQ08334 325 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 OLIG2Q13516 323 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 FLOT2Q14254 428 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF235Q14590 738 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SHBQ15464 509 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIP10Q15642 601 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CNGA3Q16281 694 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 MMEL1Q495T6 779 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 KDELC1Q6UW63 502 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 MAVSQ7Z434 540 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX32Q86XE0 403 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 DSELQ8IZU8 1212 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 EXD3Q8N9H8 876 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXO32Q969P5 355 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM136AQ96C01 138 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 BIRC7Q96CA5 298 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 NXNL1Q96CM4 212 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC39A13Q96H72 371 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC6A18Q96N87 628 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TSC22D3Q99576 134 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM15Q9C019 465 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 NT5MQ9NPB1 228 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 TREX1Q9NSU2 369 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 OSER1Q9NX31 292 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 POMPQ9Y244 141 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 VWA7Q9Y334 891 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.94□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SMARCE1-201ENST00000264640 DYTNA2CJ06 578 aa6.93□□□□□ -1.3
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