RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 GLOD4Q9HC38 313 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO5Q9UKT4 447 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 CTSLP07711 333 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 NME5P56597 212 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS14P62263 151 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 NHLH1Q02575 133 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 BNIP2Q12982 314 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 CTBP1Q13363 440 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 INPP5AQ14642 412 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 LPAL2Q16609 132 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBED5Q49AG3 693 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf10Q5SRN2 563 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 VOPP1Q96AW1 172 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 OMDQ99983 421 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ACSS2Q9NR19 701 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF11O60813 436 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 LILRB5O75023 590 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 BCKDHBP21953 392 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 DENND5AQ6IQ26 1287 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR141Q7Z602 305 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 EXOC2Q96KP1 924 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 MUC13Q9H3R2 512 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 UBP1Q9NZI7 540 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC167Q9P0B6 97 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 SERGEFQ9UGK8 458 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP8B1Q9UNU6 501 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM64A6NGJ6 449 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 A8MT66 165 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 PLK4O00444 970 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 MYF6P23409 242 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ARNTP27540 789 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ADRA1AP35348 466 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 BBS5Q8N3I7 341 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC45A3Q96JT2 553 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFAF1Q9Y375 327 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 MAFKO60675 156 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 GJB3O75712 270 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V0D1P61421 351 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 POU6F1Q14863 301 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 HMBOX1Q6NT76 420 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 NEPROQ6NW34 567 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC49Q8IUZ0 686 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ATPAF2Q8N5M1 289 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 FNDC8Q8TC99 324 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 L3HYPDHQ96EM0 354 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC29A1Q99808 456 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 CIB1Q99828 191 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAF6Q9Y4K3 522 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 MID1O15344 667 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 PEX11BO96011 259 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 IMPDH1P20839 514 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF470Q6ECI4 717 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ISLR2Q6UXK2 745 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.735e-7■■■□□ 15.7
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM124AQ86V42 546 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO1HQ8N1T3 1032 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf16Q9BUW7 83 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 MATN3O15232 486 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 RPP40O75818 363 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 FCGR1AP12314 374 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 HSD17B1P14061 328 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 IL10P22301 178 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 P2RY2P41231 377 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 RGRP47804 291 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 TPMTP51580 245 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF460Q14592 562 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 COQ5Q5HYK3 327 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB119Q8N690 84 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 FICDQ9BVA6 458 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 SP110Q9HB58 689 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCD2Q9UBJ2 740 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 MUSKO15146 869 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXM1Q08050 763 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC10A7Q0GE19 358 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 IPMKQ8NFU5 416 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 FEM1CQ96JP0 617 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms