RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 BRINP1O60477 761 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 DXOO77932 396 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 HGFP14210 728 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 PKMP14618 531 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 PLTPP55058 493 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 GABREP78334 506 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 GBX1Q14549 363 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 PHF19Q5T6S3 580 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 CNSTQ6PJW8 725 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 IGF2-ASQ6U949 168 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 RAB11FIP2Q7L804 512 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ASZ1Q8WWH4 475 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 TMEM159Q96B96 161 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 NXPE2Q96DL1 559 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 PANX3Q96QZ0 392 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 FERD3LQ96RJ6 166 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 RAB33BQ9H082 229 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ASCL3Q9NQ33 180 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 MOCS1Q9NZB8 636 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 SLC17A6Q9P2U8 582 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 EPHA6Q9UF33 1036 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-201ENST00000236273 ESYT3A0FGR9 886 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 PFDN6O15212 129 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 AMD1P17707 334 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 NDUFS1P28331 727 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 CAPZBP47756 277 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 PPP1CAP62136 330 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.062e-11■■□□□ 13.4
SYF2-201ENST00000236273 C8orf74Q6P047 294 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 OR5AR1Q8NGP9 310 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 SLC46A1Q96NT5 459 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 SLC30A3Q99726 388 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 FAM167BQ9BTA0 163 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 TSSK1BQ9BXA7 367 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 STRADBQ9C0K7 418 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 MVB12BQ9H7P6 319 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 AK5Q9Y6K8 562 aa21.7■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ACACAQ13085 2346 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ZFHX4Q86UP3 3567 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ZZEF1O43149 2961 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 LAMA5O15230 3695 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 H3BMM5 538 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 AGRPO00253 132 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 PLD2O14939 933 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 AHSGP02765 367 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 CTAGE8P0CG41 777 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ETV5P41161 510 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 CARSP49589 748 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 CLCN7P51798 805 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 SYTL3Q4VX76 610 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ZNF449Q6P9G9 518 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ZBED8Q8IZ13 594 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 FBXO39Q8N4B4 442 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ACVR1CQ8NER5 493 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 LOXL2Q9Y4K0 774 aa21.69■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 TMEM8BA6NDV4 472 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 HGSO14964 777 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 APOA4P06727 396 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 CCL4P13236 92 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 CAV1Q03135 178 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 PRKG2Q13237 762 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 PLXDC1Q8IUK5 500 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 MNS1Q8NEH6 495 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 OR52E1Q8NGJ3 308 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 OR5K2Q8NHB8 316 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 GIMAP7Q8NHV1 300 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 FAM136AQ96C01 138 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 C9orf72Q96LT7 481 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 TWSG1Q9GZX9 223 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 SEMA5BQ9P283 1151 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ASF1AQ9Y294 204 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 USP24Q9UPU5 2620 aa21.68■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 OR5K3A6NET4 321 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 A8MU76 341 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 CDRT15L2A8MXV6 281 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 ITIH1P19827 911 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 CHRM3P20309 590 aa21.67■■□□□ 1.06
SYF2-201ENST00000236273 GUCY2DQ02846 1103 aa21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms