RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000202170.3

Pds5b-208, Transcript of Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Pds5b, Length 6,598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gon7P0C8B4 98 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Lamp1P11438 406 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Fbxo40P62932 710 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Prokr2Q8K458 381 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Mptx1Q8R1M8 219 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Slc5a9Q8VDT1 685 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 OgfrQ99PG2 633 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Kiaa0141Q9DCV6 510 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Akr1a1Q9JII6 325 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 2610001J05RikF2Z3Y9 59 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Asgr1P34927 284 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Nr2e1Q64104 385 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 SowahaQ8BLS7 548 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rpl14Q9CR57 217 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Akap12Q9WTQ5 1684 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 OgdhQ60597 1023 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr1346Q8VGH6 313 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Exosc1Q9DAA6 195 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Xpr1Q9Z0U0 695 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Mybpc1D3YU50 1127 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 SqleP52019 572 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Tspan5P62080 268 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rps14P62264 151 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Perm1Q149B8 807 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 MertkQ60805 994 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr664Q7TRP5 306 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Wdr48Q8BH57 676 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr342Q8VGK7 312 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Sh3d19Q91X43 789 aa15.49■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm3636E9Q5P1 227 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Slc6a6O35316 621 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Lhx1P63006 406 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ccdc177Q3UHB8 706 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Zfp62Q8C827 914 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Col23a1Q8K4G2 532 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr606Q8VGZ8 319 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Prl2b1Q9DAZ2 228 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 DnpepQ9Z2W0 473 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ccdc166S4R181 449 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Sh3pxd2bA2AAY5 908 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 SpnP15702 395 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 WarsP32921 481 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 BcheQ03311 603 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Foxr1Q3UTB7 268 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Arhgap20Q6IFT4 1182 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Snx6Q6P8X1 406 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Pcdh8Q7TSK3 1070 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 GnalQ8CGK7 381 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr700Q8VFM5 316 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Nmrk2Q9D7C9 195 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Slc7a8Q9QXW9 531 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm7792A0A0J9YU01 481 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm3183D3YUJ6 481 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Nsmce4aG3XA30 381 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm3139J3QK78 481 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm3106J3QPH3 481 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Slc22a8O88909 537 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Sh3pxd2aO89032 1124 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 MtpnP62774 118 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 ZyxQ62523 564 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 AptxQ7TQC5 342 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Pum1Q80U78 1189 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Insig1Q8BGI3 259 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Plekha1Q8BUL6 383 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 FlcnQ8QZS3 579 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Zfp940Q8R2Q3 566 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Mup4P11590 178 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ccnd3P30282 292 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Tmem45aQ60774 273 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Nr0b2Q62227 260 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 N6amt1Q6SKR2 214 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Dnajb13Q80Y75 316 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Grhl1Q921D9 618 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Vsig1Q9D2J4 407 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Mllt3A2AM29 569 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 H2-Q7P14429 334 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 H2-Q9P14431 200 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rps6ka3P18654 740 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ntf3P20181 258 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ecm1Q61508 559 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Serpina3aQ6P4P1 422 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Smarcd3Q6P9Z1 483 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rcn3Q8BH97 328 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Asrgl1Q8C0M9 326 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Fem1cQ8CEF1 617 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Zmiz2Q8CIE2 920 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Agpat3Q9D517 376 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ing1Q9QXV3 279 aa15.48■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Adamts6D3Z1A5 1117 aa15.47■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rdh8D3Z6W3 317 aa15.47■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Zfp105G3X9I0 524 aa15.47■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Vmn2r93L7N1Z9 857 aa15.47■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Mid1O70583 680 aa15.47■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Svs4P18419 113 aa15.47■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ap1s1P61967 158 aa15.47■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Irf6P97431 467 aa15.47■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Il1rapQ61730 570 aa15.47■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Kiaa0895Q7TQE7 519 aa15.47■□□□□ 0.07
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Clrn1Q8K445 232 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.2 ms