RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP206Q8IYR0 622 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 OXR1Q8N573 874 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF781Q8N8C0 355 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf82Q8WW14 230 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 BMFQ96LC9 184 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 TRMOQ9BU70 441 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 TPSD1Q9BZJ3 242 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 EBF2Q9HAK2 575 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNK13Q9HB14 408 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PNPOQ9NVS9 261 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKAB1Q9Y478 270 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC14BA6NHZ5 514 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 GRID2O43424 1007 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CEACAM5P06731 702 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS17P08708 135 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 KITP10721 976 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 VCLP18206 1134 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN2P57739 230 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ZXDAP98168 799 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CAMKK1Q8N5S9 505 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 RMI1Q9H9A7 625 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PARVBQ9HBI1 364 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PDE10AQ9Y233 779 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 KMOO15229 486 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 FUCA1P04066 466 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PDHA2P29803 388 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 AGTR2P50052 363 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1024LP59773 190 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 NAA20P61599 178 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKAA1Q13131 559 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CDKL4Q5MAI5 379 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXR1Q6PIV2 292 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 AMZ2Q86W34 360 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 FRMD1Q8N878 549 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKS4BQ8N8V4 417 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR174Q9BXC1 333 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC23A2Q9UGH3 650 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 DCTN4Q9UJW0 460 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BM21 787 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 GUCA1CO95843 209 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 S100BP04271 92 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 DCNP07585 359 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 MPSTP25325 297 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 AKT2P31751 481 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 MAPK9P45984 424 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 RPIAP49247 311 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CDKL1Q00532 357 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 NFE2L1Q14494 772 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKS6Q68DC2 871 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 GCNT7Q6ZNI0 430 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM145Q8NBT3 493 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 RLN3Q8WXF3 142 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 DPEP2Q9H4A9 486 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CA5BQ9Y2D0 317 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL33A6NCF5 533 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 FSBPO95073 299 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CCR3P51677 355 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PFN3P60673 137 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ABRQ12979 859 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.493e-9■□□□□ 10.3
CAPNS1-215ENST00000628018 ZSCAN26Q16670 478 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO48Q5FWF7 155 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 SULT1C3Q6IMI6 304 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 BIRC7Q96CA5 298 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 RHBDF1Q96CC6 855 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 SIKE1Q9BRV8 207 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 IER2Q9BTL4 223 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM54Q9BYV2 358 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 TM7SF3Q9NS93 570 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0G2JND7 137 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 H0Y8X5 98 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 TAPBPO15533 448 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP2A7P20853 494 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 PXNP49023 591 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL14P50914 215 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 RPA4Q13156 261 aa24.34■■□□□ 1.49
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms