RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 KCNJ13O60928 360 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 SLC35G4P0C7Q5 338 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CD9P21926 228 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 DGKAP23743 735 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CRABP2P29373 138 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 TYK2P29597 1187 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 CCT8P50990 548 aa8.34□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 NHLH1Q02575 133 aa8.34□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 RASA2Q15283 850 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CSRP2Q16527 193 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 DEFB133Q30KQ1 61 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 METRNLQ641Q3 311 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 PAQR3Q6TCH7 311 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 XKR5Q6UX68 686 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 GATAD2AQ86YP4 633 aa8.34□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 WWP1Q9H0M0 922 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 VPS11Q9H270 941 aa8.34□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF446Q9NWS9 450 aa8.34□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 TAAR2Q9P1P5 351 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 KLHL42Q9P2K6 505 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 TBC1D29Q9UFV1 150 aa8.34□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 ACSL5Q9ULC5 683 aa8.34□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 PSMD13Q9UNM6 376 aa8.34□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 A0A096LPK6 155 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PPM1 405 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 GOLGA6L10A6NI86 522 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 PRR19A6NJB7 356 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 B4DGG1 531 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 LMO7DNF2Z398 122 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 GOLGA8RI6L899 631 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 YY2O15391 372 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 LRP3O75074 770 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 GPC4O75487 556 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 RFPL1O75677 317 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SASH3O75995 380 aa8.33□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 MPOP05164 745 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ANXA6P08133 673 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 MYZAPP0CAP1 466 aa8.33□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 CCDC166P0CW27 439 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CBSLP0DN79 551 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 PDHA2P29803 388 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CBSP35520 551 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 GMPRP36959 345 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 HALP42357 657 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 RGS4P49798 205 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 IL2P60568 153 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 IRF9Q00978 393 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 DNAJC3Q13217 504 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 GBX1Q14549 363 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 PPM1JQ5JR12 505 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM207Q6UWW9 146 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CROCCP2Q86T23 111 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SLC22A15Q8IZD6 547 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CNPY4Q8N129 248 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 MYO1HQ8N1T3 1032 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A45Q8N413 288 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 SAP25Q8TEE9 199 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 MZB1Q8WU39 189 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 GLMNQ92990 594 aa8.33□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ISL2Q96A47 359 aa8.33□□□□□ -1.08
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