RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 CLIC3O95833 236 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 ERVK-10P10266 1014 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 ATP6V1B2P21281 511 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 ITKQ08881 620 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 HSPA14Q0VDF9 509 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 GALNT2Q10471 571 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 SREBF2Q12772 1141 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 TSC22D1Q15714 1073 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 TPRG1LQ5T0D9 272 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 ATAD3CQ5T2N8 411 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 OVOS1Q6IE37 1185 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 ZYG11AQ6WRX3 759 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 LUZP2Q86TE4 346 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 NOXA1Q86UR1 476 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 PM20D2Q8IYS1 436 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 EID3Q8N140 333 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 PYROXD2Q8N2H3 581 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 AADATQ8N5Z0 425 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 ENKURQ8TC29 256 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 PEX13Q92968 403 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 SERPINB11Q96P15 392 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 TBL1YQ9BQ87 522 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 SYT17Q9BSW7 474 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 C12orf49Q9H741 205 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 TAS2R9Q9NYW1 312 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 A0A087X1B8 175 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC78A2IDD5 438 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 METTL12A8MUP2 240 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 GABRDO14764 452 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 FAM20BO75063 409 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 TSC22D2O75157 780 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 TULP3O75386 442 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 CTSHP09668 335 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 BMP4P12644 408 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 ATF6P18850 670 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 CXCR3P49682 368 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 ALDH3A2P51648 485 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 NRLP54845 237 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 DSTNP60981 165 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 QPRTQ15274 297 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 UBXN11Q5T124 520 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 SCN4BQ8IWT1 228 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 MIER2Q8N344 545 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 KCTD4Q8WVF5 259 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 STON2Q8WXE9 905 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 MUS81Q96NY9 551 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 DCSTAMPQ9H295 470 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 RHOJQ9H4E5 214 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 FBXO44Q9H4M3 255 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 CASS4Q9NQ75 786 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 MTMR10Q9NXD2 777 aa5.89□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 I3L521 148 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 PLD2O14939 933 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 DCLK1O15075 740 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 GNRH1P01148 92 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 IL2RAP01589 272 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 CAPNS1P04632 268 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 PSKH1P11801 424 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 NFKB1P19838 968 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 TYMPP19971 482 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 ETV1P50549 477 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 RENBPP51606 427 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 BEX3Q00994 111 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 DUSP7Q16829 419 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 FAM83EQ2M2I3 478 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 C6orf141Q5SZD1 244 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 LRRC8DQ7L1W4 858 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 AMIGO1Q86WK6 493 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 PLCZ1Q86YW0 608 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 MPP5Q8N3R9 675 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 FCGR1BQ92637 280 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 NT5C3BQ969T7 300 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 MYLPFQ96A32 169 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 TEKT5Q96M29 485 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 SP110Q9HB58 689 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 SYTL2Q9HCH5 934 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 OXSMQ9NWU1 459 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF224Q9NZL3 707 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 V9GYQ6 96 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 EP400Q96L91 3159 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 OR6C70A6NIJ9 312 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 G3V2T6 193 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-210ENST00000592582 PLK4O00444 970 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms