RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 GLMNQ92990 594 aa28.55■■■□□ 2.16
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PDE10AQ9Y233 779 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 EGFP01133 1207 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAPK9P45984 424 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 HSPA7P48741 367 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 AGERQ15109 404 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 CYB5D1Q6P9G0 228 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 HOMEZQ8IX15 550 aa28.54■■■□□ 2.16
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KCNK12Q9HB15 430 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARL15Q9NXU5 204 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 OPTCQ9UBM4 332 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 GSC2O15499 205 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 VPS4BO75351 444 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCDH8O95206 1070 aa28.53■■■□□ 2.16
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CTDNEP1-208ENST00000573600 EZRP15311 586 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 GSTM4Q03013 218 aa28.53■■■□□ 2.16
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM198Q66K66 360 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.162e-7■□□□□ 8.8
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC44A3Q8N4M1 653 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL17RCQ8NAC3 791 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCNA7Q96RP8 456 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 MIPEPQ99797 713 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCT7Q99832 543 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM79Q9BSE2 394 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 C5orf42Q9H799 3197 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1W2PP55 124 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC5A10A0PJK1 596 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIP5K1BO14986 540 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBDO15205 165 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 VEGFDO43915 354 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 OTCP00480 354 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 COX4I1P13073 169 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIK3R1P27986 724 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIK3CGP48736 1102 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 HNMTP50135 292 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 AP1S2P56377 157 aa28.52■■■□□ 2.16
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MCOLN3Q8TDD5 553 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIC2Q96JB3 615 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 HEBP1Q9NRV9 189 aa28.52■■■□□ 2.16
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GGT5P36269 586 aa28.52■■■□□ 2.16
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MXRA7P84157 204 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 FBXW10Q5XX13 1052 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA1211LQ6NV74 962 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 RASGRP3Q8IV61 690 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 DDIASQ8IXT1 998 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGAP24Q8N264 748 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP6V1E2Q96A05 226 aa28.52■■■□□ 2.16
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR34Q9UPC5 381 aa28.52■■■□□ 2.16
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PNCKQ6P2M8 343 aa28.5■■■□□ 2.15
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OR52B6Q8NGF0 335 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 COX14Q96I36 57 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 C3orf30Q96M34 536 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 TUBB1Q9H4B7 451 aa28.5■■■□□ 2.15
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