RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 A6NL46 340 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 CCL22O00626 93 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 SEMA7AO75326 666 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 CDH3P22223 829 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 RAPSNQ13702 412 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 TRIM14Q14142 442 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 PTCHD3Q3KNS1 767 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 FHL5Q5TD97 284 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 IZUMO3Q5VZ72 239 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 CFAP206Q8IYR0 622 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 OR1L3Q8NH93 324 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 HEMGNQ9BXL5 484 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 MLXIPLQ9NP71 852 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 POMT2Q9UKY4 750 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 ACSL5Q9ULC5 683 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 TFR2Q9UP52 801 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa15.1■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 TMEM150CB9EJG8 249 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 MEN1O00255 615 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 ZNF185O15231 689 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 PSTPIP1O43586 416 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 SRP72O76094 671 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 TMEM63AO94886 807 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 PVRP15151 417 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 LPOP22079 712 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 RBL1P28749 1068 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 RORAP35398 523 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 LMAN1P49257 510 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 ITGA1P56199 1179 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 TMPRSS15P98073 1019 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 KRT33BQ14525 404 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 BCL7AQ4VC05 210 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 TFDP3Q5H9I0 405 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 FAM198BQ6UWH4 519 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 VSTM4Q8IW00 320 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 DSELQ8IZU8 1212 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 FDCSPQ8NFU4 85 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 OR13C4Q8NGS5 318 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 CPT1BQ92523 772 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 VAT1Q99536 393 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 NUDT9Q9BW91 350 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 GBA3Q9H227 469 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 FANCEQ9HB96 536 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 PCMTD2Q9NV79 361 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 MAP10Q9P2G4 905 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 CRLS1Q9UJA2 301 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 TCFL5Q9UL49 500 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 ALG6Q9Y672 507 aa15.09■□□□□ 0.01
NME3-211ENST00000568561 A1L4Q6 167 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 H7C0C1 242 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 BTN3A3O00478 584 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 BTN3A1O00481 513 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 CAPN1P07384 714 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 ST6GAL1P15907 406 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 ATP5OP48047 213 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 PREPP48147 710 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 GSDMDP57764 484 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 XIAPP98170 497 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 PRKAA1Q13131 559 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 ZNF789Q5FWF6 425 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 SYTL1Q8IYJ3 562 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 KATNAL2Q8IYT4 538 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 Q8NA96 180 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 OR8K5Q8NH50 307 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 LCN9Q8WX39 176 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 KRT35Q92764 455 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 LRFN5Q96NI6 719 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 FAM118BQ9BPY3 351 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 SRMSQ9H3Y6 488 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 LATS2Q9NRM7 1088 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 TRHDEQ9UKU6 1024 aa15.08■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 MACROD2A1Z1Q3 448 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 CCDC66A2RUB6 948 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 C2orf81A6NN90 581 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 CBFA2T2O43439 604 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 CEACAM4O75871 244 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 TPM1P09493 284 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 CYP2A7P20853 494 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 PSMB4P28070 264 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 PRLHRP49683 370 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 GEMP55040 296 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 ATP1A4Q13733 1029 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 TCEAL1Q15170 157 aa15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
NME3-211ENST00000568561 NXPE1Q8N323 547 aa15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms