RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 F2RL1P55085 397 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CDC16Q13042 620 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 TMEM187Q14656 261 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 ALS2CLQ60I27 953 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SH2D6Q7Z4S9 175 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 HM13Q8TCT9 377 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SMARCE1Q969G3 411 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SEMA3CQ99985 751 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SLX1AQ9BQ83 275 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 PSD2Q9BQI7 771 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SIX2Q9NPC8 291 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 ECHDC1Q9NTX5 307 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 TAS2R10Q9NYW0 307 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 GGA3Q9NZ52 723 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 PAK5Q9P286 719 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 COPG2Q9UBF2 871 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 RASAL2Q9UJF2 1139 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 YIPF1Q9Y548 306 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CLIC4Q9Y696 253 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 OVOS2Q6IE36 1432 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 QSER1Q2KHR3 1735 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 PEAK1Q9H792 1746 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 KCPQ6ZWJ8 1503 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 DUOX2Q9NRD8 1548 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 MBD5Q9P267 1494 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 STK36Q9NRP7 1315 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CCDC144AA2RUR9 1427 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 H7C423 109 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 TYMPP19971 482 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 OLR1P78380 273 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 TFAP4Q01664 338 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 LRMPQ12912 555 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 BIRC3Q13489 604 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SEPT14Q6ZU15 432 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 HACE1Q8IYU2 909 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SPAG16Q8N0X2 631 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 FGFBP3Q8TAT2 258 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 SMPDL3BQ92485 455 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 MOCOSQ96EN8 888 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 CDK19Q9BWU1 502 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 WASH6PQ9NQA3 447 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 RRN3Q9NYV6 651 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 LMTK2Q8IWU2 1503 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 AGRNO00468 2067 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 FLT1P17948 1338 aa2.96□□□□□ -1.93
RRN3-204ENST00000561685 PKD1L2Q7Z442 2459 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 HFM1A2PYH4 1435 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 TECPR2O15040 1411 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 TNS3Q68CZ2 1445 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 RRN3P2A6NIE6 340 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 MAGEB17A8MXT2 336 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 PRR32B1ATL7 298 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 GPR137BO60478 399 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 PEX14O75381 377 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 CSPG5O95196 566 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 BMP10O95393 424 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 ICAM1P05362 532 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 KRT19P08727 400 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 BMXP51813 675 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 DSCR10P59022 87 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 TAS2R40P59535 323 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 MFAP5Q13361 173 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 FFAR4Q5NUL3 377 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 TRIM65Q6PJ69 517 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 ISCA2Q86U28 154 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 OR2T12Q8NG77 320 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 MRGPRDQ8TDS7 321 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 FAM222BQ8WU58 562 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 SMC6Q96SB8 1091 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 RHNO1Q9BSD3 238 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 PIGMQ9H3S5 423 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 EPB41L5Q9HCM4 733 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 ATAD3AQ9NVI7 634 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3-204ENST00000561685 COQ3Q9NZJ6 369 aa2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms