RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559557.1

MRPS11-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S11, human

TSL 3

Gene MRPS11, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS11-208	ENST00000559557	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	HYI	Q5T013	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	LIN9	Q5TKA1	542 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	STAM	Q92783	540 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PLIN2	Q99541	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CDH7	Q9ULB5	785 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CCDC169	A6NNP5	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557		K7ERI5	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	DNPH1	O43598	174 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	OR4Q2	P0C623	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	MCF2	P10911	925 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TDGF1	P13385	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	KCNE1	P15382	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	GJA1	P17302	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PRPH	P41219	470 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	EFNA5	P52803	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CDH12	P55289	794 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	VIT	Q6UXI7	678 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ERMN	Q8TAM6	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	RMDN1	Q96DB5	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ACACB	O00763	2458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	BPTF	Q12830	3046 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PTPRB	P23467	1997 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CACNA1G	O43497	2377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ITM2A	O43736	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ECI2	O75521	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TOM1L1	O75674	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SERPINI2	O75830	405 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	KRT36	O76013	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	GJB2	P29033	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PPP3CC	P48454	512 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ARPP19	P56211	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TWF1	Q12792	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PDIA5	Q14554	519 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	MTSS1L	Q765P7	747 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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