RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556321.1

PSMA3-210, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-210	ENST00000556321	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC22A12	Q96S37	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	INTS14	Q96SY0	518 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	ATP10D	Q9P241	1426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321		A0A0B4J293	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC30A4	O14863	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	PLPP2	O43688	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	BCAR3	O75815	825 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	EGF	P01133	1207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	DANCR	P0C864	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	G6PD	P11413	515 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	PSMA3	P25788	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	NMBR	P28336	390 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	CDC25C	P30307	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	PIGA	P37287	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	PRKCI	P41743	596 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	RASSF2	P50749	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	SELENOV	P59797	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	BPIFB3	P59826	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	AP1B1	Q10567	949 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	HSPB3	Q12988	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	COASY	Q13057	564 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	DECR1	Q16698	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	DCST1	Q5T197	706 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	ATL1	Q8WXF7	558 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	EXT2	Q93063	718 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	EXOC4	Q96A65	974 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	NXNL1	Q96CM4	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF558	Q96NG5	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	USP47	Q96K76	1375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	FEZF1	A0PJY2	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	C19orf81	C9J6K1	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	PPP6C	O00743	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	PTGES	O14684	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	LDB2	O43679	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	TLR2	O60603	784 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF217	O75362	1048 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	KCNK5	O95279	499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	PTPN3	P26045	913 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	AMPH	P49418	695 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	PROK1	P58294	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	ID2	Q02363	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	MELK	Q14680	651 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	NR1D2	Q14995	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321		Q5PR19	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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