RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 SOX11P35716 441 aa20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 MMP12P39900 470 aa20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 VITQ6UXI7 678 aa20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 AP2M1Q96CW1 435 aa20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 C19orf43Q9BQ61 176 aa20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 GPR45Q9Y5Y3 372 aa20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.54■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 NFATC1O95644 943 aa20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 MSH3P20585 1137 aa20.54■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 PREPP48147 710 aa20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 FLOT2Q14254 428 aa20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 XKR7Q5GH72 579 aa20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 C6orf136Q5SQH8 315 aa20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa20.54■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 KXD1Q9BQD3 176 aa20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 CASP2P42575 452 aa20.53■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 LPCAT4Q643R3 524 aa20.53■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.53■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.53■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 PRORSD1PA6NEY8 169 aa20.53■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 MMP20O60882 483 aa20.53■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 HMGCS1Q01581 520 aa20.53■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 FBXL19Q6PCT2 694 aa20.53■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 DPPA4Q7L190 304 aa20.53■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 ULK4Q96C45 1275 aa20.53■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 NDE1Q9NXR1 346 aa20.53■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.52■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 CHFRQ96EP1 664 aa20.52■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 LRRC42Q9Y546 428 aa20.52■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 A0A1W2PQ67 120 aa20.52■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 HMOX2P30519 316 aa20.52■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 PLIN5Q00G26 463 aa20.52■□□□□ 0.88
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PRDM4-205ENST00000550376 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF284Q2VY69 593 aa20.52■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 SULT1C3Q6IMI6 304 aa20.52■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 TLDC1Q6P9B6 456 aa20.52■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 KBTBD6Q86V97 674 aa20.52■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 DNAJC9Q8WXX5 260 aa20.52■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 ST14Q9Y5Y6 855 aa20.52■□□□□ 0.88
PRDM4-205ENST00000550376 TSPAN11A1L157 253 aa20.51■□□□□ 0.87
PRDM4-205ENST00000550376 H3BNX3 289 aa20.51■□□□□ 0.87
PRDM4-205ENST00000550376 STK16O75716 305 aa20.51■□□□□ 0.87
PRDM4-205ENST00000550376 OTCP00480 354 aa20.51■□□□□ 0.87
PRDM4-205ENST00000550376 ASLP04424 464 aa20.51■□□□□ 0.87
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PRDM4-205ENST00000550376 ERAP2Q6P179 960 aa20.51■□□□□ 0.87
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PRDM4-205ENST00000550376 ASB11Q8WXH4 323 aa20.51■□□□□ 0.87
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PRDM4-205ENST00000550376 K7EPI3 171 aa20.51■□□□□ 0.87
PRDM4-205ENST00000550376 SOX9P48436 509 aa20.51■□□□□ 0.87
PRDM4-205ENST00000550376 ACADVLP49748 655 aa20.51■□□□□ 0.87
PRDM4-205ENST00000550376 CCSMST1Q4G0I0 132 aa20.51■□□□□ 0.87
PRDM4-205ENST00000550376 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa20.51■□□□□ 0.87
PRDM4-205ENST00000550376 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.51■□□□□ 0.87
PRDM4-205ENST00000550376 CYP2R1Q6VVX0 501 aa20.51■□□□□ 0.87
PRDM4-205ENST00000550376 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa20.51■□□□□ 0.87
PRDM4-205ENST00000550376 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.51■□□□□ 0.87
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