RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 MDM1Q8TC05 714 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 HM13Q8TCT9 377 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 GLMNQ92990 594 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 RMDN2Q96LZ7 410 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 SELENOSQ9BQE4 189 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 TIMM29Q9BSF4 260 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 LRRC61Q9BV99 259 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 DERL2Q9GZP9 239 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 KCNH6Q9H252 994 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 ALG9Q9H6U8 611 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 SENP1Q9P0U3 644 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 TLK1Q9UKI8 766 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 PSMD13Q9UNM6 376 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 LAMA1P25391 3075 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 ZNF292O60281 2723 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 A6NCN8 305 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 NEMP2A6NFY4 417 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 TARM1B6A8C7 271 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 PLIN3O60664 434 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 SDC3O75056 442 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 GLRA3O75311 464 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 CSF2P04141 144 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 APOA4P06727 396 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 COL6A2P12110 1019 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 JUNDP17535 347 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 NR1D1P20393 614 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 RPL10P27635 214 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 ACADLP28330 430 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 SLC26A3P40879 764 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 NUBP1P53384 320 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 IL2P60568 153 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 OVGP1Q12889 678 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 C1orf61Q13536 156 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 SHBQ15464 509 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 PHKG1Q16816 387 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 PPP1R3AQ16821 1122 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 TTLL9Q3SXZ7 439 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 SYTL3Q4VX76 610 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 UGT3A1Q6NUS8 523 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 SBSNQ6UWP8 590 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 SYT12Q8IV01 421 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 SLC22A15Q8IZD6 547 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 ANKRD42Q8N9B4 389 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 CABS1Q96KC9 395 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 ATOH8Q96SQ7 321 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 NRTNQ99748 197 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 TSSK1BQ9BXA7 367 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 WWP1Q9H0M0 922 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 CAPN10Q9HC96 672 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 SYTL2Q9HCH5 934 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 KCNK9Q9NPC2 374 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 PRDM8Q9NQV8 689 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 XPR1Q9UBH6 696 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 TBC1D29Q9UFV1 150 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 PLLPQ9Y342 182 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 TMEM131Q92545 1883 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 CACNA1EQ15878 2313 aa7.96□□□□□ -1.13
CS-216ENST00000549221 ARHGEF33A8MVX0 844 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-216ENST00000549221 F8W8V4 182 aa7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms